More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2136 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  100 
 
 		 1120 aa  2262    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  67.93 
 
 		 2000 aa  1162    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  74.24 
 
 		 551 aa  606  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  80.87 
 
 		 2272 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  88.25 
 
 		 575 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  85.8 
 
 		 1969 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  85.59 
 
 		 2122 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  84.32 
 
 		 1300 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  82.27 
 
 		 1241 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  83.78 
 
 		 1882 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  84.98 
 
 		 978 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  81.48 
 
 		 1682 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  84.18 
 
 		 2036 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  81.19 
 
 		 1842 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  82.48 
 
 		 961 aa  535  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  70.57 
 
 		 561 aa  446  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  68.47 
 
 		 752 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  64.37 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  62.43 
 
 		 859 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  82.72 
 
 		 547 aa  403  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  63.8 
 
 		 713 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  62.87 
 
 		 679 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  79.84 
 
 		 791 aa  396  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  58.47 
 
 		 675 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  61.54 
 
 		 669 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  73.23 
 
 		 581 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  57.42 
 
 		 735 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  59.71 
 
 		 1094 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  61.98 
 
 		 658 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.52 
 
 		 1356 aa  347  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  52.46 
 
 		 1667 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  49 
 
 		 1361 aa  333  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  65.99 
 
 		 615 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  54.05 
 
 		 2554 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.6 
 
 		 528 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  46.67 
 
 		 1862 aa  301  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  50 
 
 		 963 aa  300  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.67 
 
 		 1282 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  49.16 
 
 		 930 aa  293  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.08 
 
 		 530 aa  288  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 460 aa  287  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  56.12 
 
 		 3295 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  56.39 
 
 		 1732 aa  278  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  77.47 
 
 		 184 aa  278  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  51.45 
 
 		 910 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  45.05 
 
 		 958 aa  268  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  43.14 
 
 		 941 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  42.74 
 
 		 838 aa  253  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.17 
 
 		 1236 aa  250  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  42.61 
 
 		 1528 aa  247  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  72.46 
 
 		 560 aa  247  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  47.21 
 
 		 1667 aa  242  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.78 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  69.75 
 
 		 644 aa  231  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  39.77 
 
 		 971 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.35 
 
 		 1292 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.75 
 
 		 1387 aa  222  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.52 
 
 		 869 aa  217  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  41.75 
 
 		 1783 aa  218  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.29 
 
 		 930 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.64 
 
 		 443 aa  209  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 		 823 aa  202  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  45.9 
 
 		 840 aa  201  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  41.03 
 
 		 1011 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.33 
 
 		 870 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  45.42 
 
 		 719 aa  195  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.23 
 
 		 786 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.21 
 
 		 938 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.67 
 
 		 777 aa  191  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  40.58 
 
 		 845 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.9 
 
 		 2552 aa  190  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.92 
 
 		 802 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 819 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  37.01 
 
 		 952 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.04 
 
 		 1095 aa  183  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.64 
 
 		 2176 aa  181  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.81 
 
 		 439 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  55.49 
 
 		 519 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  38.41 
 
 		 1814 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  57.31 
 
 		 1328 aa  172  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 1380 aa  171  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  38.87 
 
 		 929 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.68 
 
 		 1189 aa  171  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  44.59 
 
 		 1531 aa  162  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  41.92 
 
 		 408 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  48.48 
 
 		 1931 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  46.01 
 
 		 500 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  46.28 
 
 		 816 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40 
 
 		 848 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.71 
 
 		 1231 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  34.06 
 
 		 1987 aa  147  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  39.53 
 
 		 821 aa  147  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.13 
 
 		 865 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  46.11 
 
 		 769 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  37.55 
 
 		 1602 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  49.7 
 
 		 1311 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  33.42 
 
 		 1606 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  44.76 
 
 		 996 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  37.89 
 
 		 586 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  39.08 
 
 		 1620 aa  135  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>