More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0726 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  63.7 
 
 		 713 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1140    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  54.37 
 
 		 675 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  54.46 
 
 		 669 aa  488  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  55.53 
 
 		 581 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  50 
 
 		 685 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  51.23 
 
 		 679 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  56.42 
 
 		 658 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  49.38 
 
 		 1001 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.35 
 
 		 615 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.37 
 
 		 971 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  40.74 
 
 		 728 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  40.04 
 
 		 938 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  74.48 
 
 		 644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  36.38 
 
 		 769 aa  280  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  73.56 
 
 		 1300 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  75.76 
 
 		 551 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  69.57 
 
 		 1842 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  78.26 
 
 		 752 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  71.68 
 
 		 1969 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  42.19 
 
 		 960 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  70.52 
 
 		 1882 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  72.46 
 
 		 1120 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  71.26 
 
 		 2036 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  71.26 
 
 		 1241 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  70.69 
 
 		 1682 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  68.51 
 
 		 184 aa  243  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  69.59 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  58.41 
 
 		 2272 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  68.75 
 
 		 791 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  68.97 
 
 		 978 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  70.35 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  72.05 
 
 		 547 aa  238  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  72.84 
 
 		 735 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  56.64 
 
 		 2122 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  41.27 
 
 		 374 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  55.75 
 
 		 2000 aa  229  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  33.57 
 
 		 819 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  64.16 
 
 		 859 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  68.12 
 
 		 1094 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  52.79 
 
 		 3295 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.73 
 
 		 1667 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.21 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  31.35 
 
 		 771 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  41.07 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  54.75 
 
 		 1732 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  56.36 
 
 		 1361 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  51.55 
 
 		 2554 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  33.24 
 
 		 1202 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  51.34 
 
 		 1236 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.07 
 
 		 1356 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  53.85 
 
 		 528 aa  179  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  53.22 
 
 		 910 aa  174  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  52.05 
 
 		 1862 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  56.17 
 
 		 519 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  53.57 
 
 		 930 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1282 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.79 
 
 		 963 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.3 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  50.62 
 
 		 838 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  36.39 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.51 
 
 		 958 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  52 
 
 		 1328 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.24 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  29.24 
 
 		 1042 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.47 
 
 		 930 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  31.73 
 
 		 1361 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.64 
 
 		 1667 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  48.07 
 
 		 1231 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.81 
 
 		 941 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  44 
 
 		 1931 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  44.13 
 
 		 996 aa  143  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  51.25 
 
 		 861 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  42.05 
 
 		 816 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  46.11 
 
 		 1531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  42.53 
 
 		 1528 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  47.16 
 
 		 840 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.76 
 
 		 1387 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  49.71 
 
 		 1311 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 		 1783 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  49.07 
 
 		 719 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  43.5 
 
 		 439 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 1279 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  45.09 
 
 		 2552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 		 845 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.09 
 
 		 870 aa  133  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.58 
 
 		 869 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.77 
 
 		 786 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  34.82 
 
 		 331 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  41.81 
 
 		 684 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.1 
 
 		 823 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  42.94 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  44.38 
 
 		 802 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  45.96 
 
 		 1292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 777 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  48.47 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  44.79 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.85 
 
 		 819 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>