135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2751 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  100 
 
 		 728 aa  1479    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  33.64 
 
 		 1202 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  43.25 
 
 		 560 aa  286  9e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  50.62 
 
 		 675 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.41 
 
 		 713 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  48.05 
 
 		 1001 aa  260  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  47.81 
 
 		 669 aa  246  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  47.9 
 
 		 938 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  45.57 
 
 		 960 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  45.94 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.08 
 
 		 658 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  42.42 
 
 		 448 aa  220  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  43.14 
 
 		 971 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  43.71 
 
 		 374 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  38.68 
 
 		 379 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.27 
 
 		 685 aa  184  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.39 
 
 		 679 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  34.08 
 
 		 1042 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  34.94 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  24.16 
 
 		 815 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  30.59 
 
 		 769 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  33.11 
 
 		 1361 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  34.37 
 
 		 331 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  31.05 
 
 		 996 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.92 
 
 		 1279 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  33.45 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  39.87 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.97 
 
 		 819 aa  118  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  30.5 
 
 		 329 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  34.47 
 
 		 195 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  31.23 
 
 		 324 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  24.81 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.36 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.94 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  28.35 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.74 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  24.63 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  24.58 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.02 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  20.22 
 
 		 449 aa  62  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  22.62 
 
 		 444 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  28.65 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.47 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  28.16 
 
 		 918 aa  58.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  24.5 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  19.85 
 
 		 442 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  28.71 
 
 		 1060 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1263 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  20.9 
 
 		 444 aa  55.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 517 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  23.35 
 
 		 620 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  27.94 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 441 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 442 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  24 
 
 		 629 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  20.59 
 
 		 440 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  22.97 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  20.45 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.1 
 
 		 438 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  28.99 
 
 		 615 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.29 
 
 		 442 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  24.28 
 
 		 435 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  29.69 
 
 		 442 aa  51.2  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  24.75 
 
 		 450 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 454 aa  50.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.34 
 
 		 446 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  26.45 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.34 
 
 		 446 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.7 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 450 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.28 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  28.12 
 
 		 450 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.63 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 442 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0824  hypothetical protein  26.24 
 
 		 814 aa  48.9  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  22.01 
 
 		 432 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  23.05 
 
 		 451 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.78 
 
 		 446 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  22.77 
 
 		 444 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  23.64 
 
 		 449 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.78 
 
 		 445 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  24.77 
 
 		 450 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  24.1 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  23.18 
 
 		 449 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.6 
 
 		 435 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  24.1 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  24.1 
 
 		 402 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 446 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  26.71 
 
 		 437 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>