More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3143 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  100 
 
 		 819 aa  1627    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  58.35 
 
 		 771 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.94 
 
 		 1667 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.41 
 
 		 971 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  51.31 
 
 		 329 aa  289  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  56.77 
 
 		 1094 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  55.78 
 
 		 335 aa  280  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  38.31 
 
 		 938 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  47.79 
 
 		 810 aa  262  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  52.9 
 
 		 354 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  34.23 
 
 		 669 aa  246  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  38.56 
 
 		 713 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  49.69 
 
 		 354 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  51.36 
 
 		 353 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.34 
 
 		 415 aa  238  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  34.76 
 
 		 675 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  52.76 
 
 		 354 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  35.83 
 
 		 581 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  34.57 
 
 		 560 aa  228  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.33 
 
 		 752 aa  224  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.92 
 
 		 658 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  46.67 
 
 		 387 aa  221  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  56.11 
 
 		 479 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48 
 
 		 689 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  46.33 
 
 		 580 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.84 
 
 		 366 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  46.67 
 
 		 391 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  44.9 
 
 		 556 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  46.21 
 
 		 332 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  40.33 
 
 		 314 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  32.55 
 
 		 679 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.14 
 
 		 317 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.92 
 
 		 607 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1001 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.48 
 
 		 457 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.33 
 
 		 320 aa  187  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  31.32 
 
 		 685 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.11 
 
 		 348 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  43.4 
 
 		 487 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.74 
 
 		 348 aa  180  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.53 
 
 		 366 aa  180  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.34 
 
 		 347 aa  179  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.74 
 
 		 348 aa  178  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  52.97 
 
 		 272 aa  178  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35 
 
 		 312 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.13 
 
 		 328 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  42.03 
 
 		 776 aa  174  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.41 
 
 		 1170 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.81 
 
 		 313 aa  172  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  38.37 
 
 		 1189 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.19 
 
 		 310 aa  168  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.88 
 
 		 451 aa  167  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.88 
 
 		 311 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.22 
 
 		 365 aa  163  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.79 
 
 		 325 aa  163  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.37 
 
 		 311 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  37.34 
 
 		 330 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  53.94 
 
 		 978 aa  157  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  50.57 
 
 		 1682 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.71 
 
 		 329 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.25 
 
 		 318 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  49.5 
 
 		 1356 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.7 
 
 		 769 aa  151  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.27 
 
 		 517 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  36.18 
 
 		 250 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.12 
 
 		 377 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  46.32 
 
 		 306 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.24 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.24 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.24 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.67 
 
 		 336 aa  145  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.59 
 
 		 316 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3498  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.93 
 
 		 540 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631028 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.15 
 
 		 2554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.3 
 
 		 332 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.77 
 
 		 479 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.47 
 
 		 314 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.24 
 
 		 488 aa  141  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  49.7 
 
 		 1732 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.1 
 
 		 383 aa  141  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  52.47 
 
 		 3295 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  54.3 
 
 		 154 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.58 
 
 		 314 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  45.37 
 
 		 1842 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.97 
 
 		 336 aa  138  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  45.26 
 
 		 575 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.19 
 
 		 314 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.33 
 
 		 362 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  50 
 
 		 1236 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.33 
 
 		 335 aa  137  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.22 
 
 		 384 aa  137  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.88 
 
 		 406 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.49 
 
 		 943 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.89 
 
 		 318 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34 
 
 		 318 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  46.43 
 
 		 861 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31 
 
 		 362 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.73 
 
 		 338 aa  135  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>