More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2844 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  100 
 
 		 1001 aa  2037    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  43.06 
 
 		 960 aa  672    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  47.46 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.56 
 
 		 938 aa  366  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  49.38 
 
 		 560 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  48.8 
 
 		 675 aa  336  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  46.75 
 
 		 713 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  47.03 
 
 		 669 aa  300  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.91 
 
 		 971 aa  277  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  43.1 
 
 		 581 aa  277  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  34.3 
 
 		 940 aa  270  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  37.1 
 
 		 564 aa  262  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  48.05 
 
 		 728 aa  260  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.86 
 
 		 685 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  41.06 
 
 		 658 aa  244  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  36.23 
 
 		 471 aa  238  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.39 
 
 		 679 aa  207  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  39.78 
 
 		 379 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.3 
 
 		 819 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  42.52 
 
 		 374 aa  189  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  31.89 
 
 		 769 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.14 
 
 		 547 aa  184  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.41 
 
 		 448 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  33.83 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  32.96 
 
 		 1202 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.85 
 
 		 777 aa  167  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.84 
 
 		 735 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.68 
 
 		 838 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  51.48 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.84 
 
 		 978 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  48.86 
 
 		 1682 aa  152  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  48.48 
 
 		 2000 aa  151  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.47 
 
 		 1094 aa  151  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.49 
 
 		 1931 aa  149  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  41 
 
 		 1300 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.57 
 
 		 2122 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  35.65 
 
 		 1042 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.26 
 
 		 1969 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  50.96 
 
 		 1882 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.96 
 
 		 963 aa  139  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  33.23 
 
 		 403 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  43.09 
 
 		 1092 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  42.92 
 
 		 635 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  49.38 
 
 		 575 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32.2 
 
 		 1279 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.19 
 
 		 861 aa  131  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  39.29 
 
 		 275 aa  128  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  49.06 
 
 		 1862 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50.91 
 
 		 1356 aa  127  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  29.93 
 
 		 1361 aa  125  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  29.18 
 
 		 996 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.51 
 
 		 1120 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  32.82 
 
 		 831 aa  122  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.11 
 
 		 3295 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  45.4 
 
 		 1842 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  32.57 
 
 		 331 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  22.38 
 
 		 815 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  39.89 
 
 		 1328 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  46.01 
 
 		 2036 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  42.58 
 
 		 1241 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  47.47 
 
 		 2272 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.24 
 
 		 1732 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.99 
 
 		 2554 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  43.29 
 
 		 460 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  27.71 
 
 		 892 aa  110  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  25.97 
 
 		 1311 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.35 
 
 		 1056 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  43.1 
 
 		 910 aa  107  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  29 
 
 		 324 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.17 
 
 		 805 aa  105  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  41.07 
 
 		 408 aa  105  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  45.34 
 
 		 2552 aa  105  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  26.92 
 
 		 329 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  39.19 
 
 		 871 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  42.51 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  27.22 
 
 		 820 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.88 
 
 		 1361 aa  102  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1121 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 528 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  39.68 
 
 		 171 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.14 
 
 		 1236 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1667 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.83 
 
 		 184 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  40.66 
 
 		 859 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  30.97 
 
 		 641 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  42.04 
 
 		 752 aa  98.6  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  39.87 
 
 		 352 aa  98.2  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  36.12 
 
 		 954 aa  98.2  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.38 
 
 		 941 aa  97.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  42.95 
 
 		 586 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  40.65 
 
 		 816 aa  95.5  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  39.33 
 
 		 245 aa  94.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.72 
 
 		 1528 aa  94.4  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  36.77 
 
 		 1667 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  44.52 
 
 		 791 aa  94.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 530 aa  94  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.88 
 
 		 840 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  37.58 
 
 		 195 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  31.69 
 
 		 525 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  37.06 
 
 		 561 aa  92.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>