220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3706 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1555    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  58.35 
 
 		 819 aa  553  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  51.89 
 
 		 1096 aa  345  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  57.56 
 
 		 329 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.86 
 
 		 940 aa  330  7e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  35.1 
 
 		 938 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  58.26 
 
 		 747 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.4 
 
 		 669 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  55.36 
 
 		 635 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  50.22 
 
 		 586 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.55 
 
 		 675 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.52 
 
 		 861 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.33 
 
 		 971 aa  198  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  32.5 
 
 		 581 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  30.94 
 
 		 713 aa  194  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  31.35 
 
 		 560 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.21 
 
 		 658 aa  191  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  31.43 
 
 		 685 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31.84 
 
 		 679 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  35.45 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1001 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  44.84 
 
 		 373 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  32.86 
 
 		 2552 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  41.78 
 
 		 405 aa  161  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  48.7 
 
 		 656 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  39.27 
 
 		 631 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  46.71 
 
 		 926 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  37.78 
 
 		 656 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  49.69 
 
 		 2122 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  37.63 
 
 		 416 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  47.31 
 
 		 2272 aa  131  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  49.39 
 
 		 978 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  50.62 
 
 		 2000 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  48.85 
 
 		 1732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.89 
 
 		 575 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.17 
 
 		 2554 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  48.17 
 
 		 1682 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  39.16 
 
 		 418 aa  124  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  33.53 
 
 		 374 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  33.94 
 
 		 960 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.9 
 
 		 1356 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  33.45 
 
 		 728 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.54 
 
 		 1969 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  41.24 
 
 		 184 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45 
 
 		 3295 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.31 
 
 		 910 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  26.7 
 
 		 769 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.12 
 
 		 2036 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  31.21 
 
 		 379 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.87 
 
 		 930 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  43.86 
 
 		 1241 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.53 
 
 		 1300 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  46.58 
 
 		 1236 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  39.18 
 
 		 1862 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  45.45 
 
 		 1842 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  40.11 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  43.27 
 
 		 1120 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.22 
 
 		 547 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  45.4 
 
 		 1882 aa  107  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  46.3 
 
 		 963 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  37.68 
 
 		 1361 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.12 
 
 		 1667 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  42.26 
 
 		 551 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.77 
 
 		 791 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  44.44 
 
 		 528 aa  101  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.72 
 
 		 1528 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.54 
 
 		 840 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  33.64 
 
 		 1021 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.59 
 
 		 930 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  40 
 
 		 1282 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.22 
 
 		 870 aa  98.6  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.52 
 
 		 615 aa  98.2  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  41.14 
 
 		 530 aa  97.4  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.88 
 
 		 823 aa  97.4  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.34 
 
 		 752 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.42 
 
 		 408 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.11 
 
 		 735 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  37.43 
 
 		 1094 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  37.99 
 
 		 561 aa  95.9  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.25 
 
 		 786 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  40.88 
 
 		 1328 aa  95.5  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  35.75 
 
 		 1667 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  41.32 
 
 		 1311 aa  94.7  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.17 
 
 		 802 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  53.41 
 
 		 471 aa  94.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  38.1 
 
 		 525 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.88 
 
 		 845 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  34.31 
 
 		 400 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.7 
 
 		 719 aa  92.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  30 
 
 		 435 aa  92  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  35.32 
 
 		 941 aa  91.3  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.13 
 
 		 1531 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  39.34 
 
 		 460 aa  89  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.04 
 
 		 838 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.04 
 
 		 859 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  40.12 
 
 		 644 aa  87.8  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.67 
 
 		 519 aa  87.8  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  37.89 
 
 		 816 aa  88.2  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  28.14 
 
 		 331 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  34.21 
 
 		 1351 aa  87  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>