More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1478 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  63.27 
 
 		 713 aa  814    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  63.03 
 
 		 685 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  66.18 
 
 		 658 aa  806    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  62.42 
 
 		 679 aa  708    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  64.15 
 
 		 581 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  100 
 
 		 675 aa  1361    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  73.35 
 
 		 669 aa  908    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  54.37 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  76.47 
 
 		 735 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  73.94 
 
 		 1094 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  71.13 
 
 		 859 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  72.7 
 
 		 752 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  70.21 
 
 		 1682 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  68.29 
 
 		 2272 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.1 
 
 		 971 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  63.53 
 
 		 1882 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  65.65 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  64.16 
 
 		 1300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  62.97 
 
 		 2036 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  62.1 
 
 		 1842 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  63.47 
 
 		 1969 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  58.47 
 
 		 1120 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  56.27 
 
 		 2000 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  57.07 
 
 		 978 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  59.1 
 
 		 2122 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  80 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  57.07 
 
 		 575 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  59.94 
 
 		 1241 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  51.96 
 
 		 1667 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  72.98 
 
 		 791 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  41.99 
 
 		 615 aa  359  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  70.43 
 
 		 547 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  54.74 
 
 		 1361 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  48.8 
 
 		 1001 aa  336  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  53.61 
 
 		 1356 aa  334  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  54.19 
 
 		 528 aa  334  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.74 
 
 		 938 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  52.82 
 
 		 963 aa  321  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.28 
 
 		 1862 aa  321  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  47.88 
 
 		 1282 aa  313  9e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  51.84 
 
 		 374 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  49.12 
 
 		 2554 aa  300  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.53 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.92 
 
 		 941 aa  280  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  48.94 
 
 		 838 aa  280  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.09 
 
 		 3295 aa  280  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  50.62 
 
 		 728 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.18 
 
 		 910 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.33 
 
 		 930 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.73 
 
 		 1732 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.2 
 
 		 460 aa  271  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  74.05 
 
 		 184 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.04 
 
 		 958 aa  264  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  46.55 
 
 		 960 aa  260  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  50.92 
 
 		 1236 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  35.63 
 
 		 769 aa  257  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  42.57 
 
 		 1528 aa  251  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.97 
 
 		 1667 aa  250  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.93 
 
 		 869 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.83 
 
 		 861 aa  249  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  45.73 
 
 		 1387 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  43.05 
 
 		 379 aa  241  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.59 
 
 		 1783 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  34.76 
 
 		 819 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  70.55 
 
 		 644 aa  230  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 823 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.12 
 
 		 1292 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.7 
 
 		 840 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.4 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  39.54 
 
 		 448 aa  211  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.88 
 
 		 719 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.82 
 
 		 870 aa  206  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.47 
 
 		 930 aa  206  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.05 
 
 		 802 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.56 
 
 		 2552 aa  199  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  32.09 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.7 
 
 		 845 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  38.86 
 
 		 2176 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  39.02 
 
 		 1011 aa  197  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  37.76 
 
 		 952 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.82 
 
 		 1189 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.26 
 
 		 1531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.9 
 
 		 777 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.8 
 
 		 1095 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  42.31 
 
 		 821 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  38.44 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.74 
 
 		 819 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.2 
 
 		 439 aa  180  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.17 
 
 		 929 aa  178  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.08 
 
 		 1814 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  55.76 
 
 		 519 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.98 
 
 		 1380 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  37.46 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  35.5 
 
 		 865 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  29.68 
 
 		 1202 aa  166  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  55.29 
 
 		 1231 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  49.08 
 
 		 500 aa  164  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  45.9 
 
 		 1931 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  50.3 
 
 		 816 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  42.13 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>