More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1440 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  879    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  57.81 
 
 		 528 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.46 
 
 		 1356 aa  316  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.12 
 
 		 1862 aa  307  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.7 
 
 		 2554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  49.41 
 
 		 859 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  51.6 
 
 		 752 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  51.34 
 
 		 1667 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  50.28 
 
 		 1842 aa  302  9e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  53.5 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  50 
 
 		 561 aa  299  7e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  49.56 
 
 		 1682 aa  299  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  50.46 
 
 		 2272 aa  297  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  49.85 
 
 		 978 aa  297  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  49.16 
 
 		 1094 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  50.61 
 
 		 1882 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  49.27 
 
 		 575 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  49.71 
 
 		 2036 aa  293  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  47.65 
 
 		 1282 aa  292  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  50.3 
 
 		 1300 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  48.43 
 
 		 1120 aa  289  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.68 
 
 		 2122 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.3 
 
 		 1241 aa  286  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  46.03 
 
 		 1361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.54 
 
 		 735 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  48.39 
 
 		 2000 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  47.6 
 
 		 713 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  50.28 
 
 		 963 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  47.62 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  47.77 
 
 		 1969 aa  280  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  48.06 
 
 		 679 aa  279  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  49.08 
 
 		 861 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.46 
 
 		 685 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  51.54 
 
 		 930 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  48.2 
 
 		 675 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  47.46 
 
 		 658 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  56.54 
 
 		 1732 aa  267  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  54.41 
 
 		 3295 aa  259  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.7 
 
 		 910 aa  259  8e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  44 
 
 		 838 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.32 
 
 		 941 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  51.38 
 
 		 547 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  43.55 
 
 		 958 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  44.14 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.26 
 
 		 1236 aa  236  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.29 
 
 		 615 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  50.62 
 
 		 1387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  53.04 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  48.79 
 
 		 791 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  37.3 
 
 		 1528 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.03 
 
 		 869 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.56 
 
 		 1667 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.22 
 
 		 1783 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.24 
 
 		 1292 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.77 
 
 		 971 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.56 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  47.04 
 
 		 519 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.78 
 
 		 786 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.12 
 
 		 840 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  45.71 
 
 		 719 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.08 
 
 		 823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.74 
 
 		 845 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.06 
 
 		 777 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.71 
 
 		 802 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 		 870 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.08 
 
 		 2552 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.31 
 
 		 819 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.3 
 
 		 1095 aa  170  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.72 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.73 
 
 		 1814 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  35.12 
 
 		 929 aa  163  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.81 
 
 		 930 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  35.31 
 
 		 952 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  53.09 
 
 		 184 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.36 
 
 		 2176 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.78 
 
 		 1531 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  38.81 
 
 		 821 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  43.58 
 
 		 938 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.71 
 
 		 1011 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  47.2 
 
 		 644 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  37.98 
 
 		 1189 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  48.24 
 
 		 560 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.21 
 
 		 865 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.27 
 
 		 848 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  50.62 
 
 		 940 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  35.28 
 
 		 1987 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40.29 
 
 		 1380 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  39.76 
 
 		 408 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  41.95 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  40.11 
 
 		 816 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.9 
 
 		 1231 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  42.25 
 
 		 1931 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  36.2 
 
 		 586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  46.55 
 
 		 1328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.52 
 
 		 1606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1620 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  33.03 
 
 		 1602 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  46.77 
 
 		 996 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  48.73 
 
 		 819 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  35.42 
 
 		 1565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>