More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2782 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  90.78 
 
 		 2272 aa  752    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  79.43 
 
 		 2036 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  77.54 
 
 		 1842 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  78.91 
 
 		 1882 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  100 
 
 		 2122 aa  4228    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  67.16 
 
 		 2000 aa  747    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  86.78 
 
 		 978 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  85.34 
 
 		 1682 aa  707    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  88.46 
 
 		 575 aa  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  85.59 
 
 		 1120 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  84.94 
 
 		 1969 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  84.85 
 
 		 1241 aa  561  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  82.53 
 
 		 1300 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  65.8 
 
 		 561 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  62.14 
 
 		 752 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.7 
 
 		 551 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.53 
 
 		 1356 aa  422  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  56.09 
 
 		 1094 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  50.4 
 
 		 735 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  85.25 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  51.83 
 
 		 1667 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.25 
 
 		 2554 aa  393  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  62.57 
 
 		 685 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  59.83 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  50.46 
 
 		 1361 aa  391  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  57.8 
 
 		 713 aa  387  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  61.11 
 
 		 669 aa  387  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  61.79 
 
 		 859 aa  387  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  76.71 
 
 		 791 aa  386  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  59.1 
 
 		 675 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.4 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  73.52 
 
 		 581 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.62 
 
 		 1862 aa  369  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  50.24 
 
 		 963 aa  364  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  59.88 
 
 		 658 aa  359  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  44.56 
 
 		 1282 aa  353  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.82 
 
 		 530 aa  345  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  49.88 
 
 		 930 aa  342  5e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  44.44 
 
 		 941 aa  331  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.09 
 
 		 958 aa  313  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  62.55 
 
 		 615 aa  308  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.79 
 
 		 1236 aa  308  7e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.55 
 
 		 838 aa  298  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  41.06 
 
 		 1528 aa  293  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.68 
 
 		 460 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  35.95 
 
 		 1328 aa  280  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.94 
 
 		 3295 aa  279  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45 
 
 		 1667 aa  276  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  78.02 
 
 		 184 aa  273  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.69 
 
 		 1732 aa  270  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  51.52 
 
 		 486 aa  268  5.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  41.45 
 
 		 1387 aa  266  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  47.78 
 
 		 322 aa  266  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  48.1 
 
 		 322 aa  266  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  48.1 
 
 		 322 aa  263  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  46.6 
 
 		 324 aa  259  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  47.37 
 
 		 910 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.78 
 
 		 1783 aa  245  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  48.02 
 
 		 861 aa  241  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  37.95 
 
 		 1011 aa  234  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  56.64 
 
 		 560 aa  234  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.64 
 
 		 971 aa  234  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  37.85 
 
 		 440 aa  231  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 840 aa  226  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.96 
 
 		 869 aa  226  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  68.32 
 
 		 644 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.23 
 
 		 823 aa  220  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.21 
 
 		 802 aa  220  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.93 
 
 		 719 aa  219  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.71 
 
 		 1292 aa  217  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.05 
 
 		 870 aa  212  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.94 
 
 		 1383 aa  212  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  34.79 
 
 		 952 aa  207  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.41 
 
 		 2176 aa  206  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.76 
 
 		 845 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.09 
 
 		 930 aa  203  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  38.29 
 
 		 961 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.94 
 
 		 443 aa  196  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  32.28 
 
 		 1311 aa  196  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.16 
 
 		 1814 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 786 aa  192  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.49 
 
 		 2552 aa  192  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 		 777 aa  190  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  41.54 
 
 		 929 aa  189  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  47.56 
 
 		 819 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  46.67 
 
 		 1095 aa  179  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  34.71 
 
 		 1987 aa  178  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  35.39 
 
 		 431 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.29 
 
 		 439 aa  175  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  35.02 
 
 		 1620 aa  175  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.44 
 
 		 938 aa  174  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.17 
 
 		 1606 aa  173  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.2 
 
 		 1380 aa  171  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 		 546 aa  171  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.08 
 
 		 1189 aa  169  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  31.57 
 
 		 1531 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 963 aa  168  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  30.57 
 
 		 865 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  48.17 
 
 		 519 aa  166  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  35.47 
 
 		 463 aa  163  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>