More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1990 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
463 aa  912    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  39.64 
 
 
431 aa  276  6e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  42.13 
 
 
963 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  43.01 
 
 
415 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  42.77 
 
 
1454 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  40.44 
 
 
475 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  45 
 
 
352 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  37.84 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  39.24 
 
 
432 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 
687 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  39.03 
 
 
795 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  37.78 
 
 
1682 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  35.67 
 
 
653 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
774 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
652 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  34.15 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  36.64 
 
 
322 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  36.64 
 
 
322 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  36.23 
 
 
322 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  37.12 
 
 
324 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  34 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.47 
 
 
2122 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  33.24 
 
 
382 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  36.73 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.83 
 
 
1383 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
861 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  34.93 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  35.78 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  34.32 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 
396 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 
514 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  33.96 
 
 
371 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.95 
 
 
374 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  34.4 
 
 
371 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 
426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  30.85 
 
 
901 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  29.54 
 
 
611 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 
445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.45 
 
 
1812 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  26.62 
 
 
397 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  31.79 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  29.62 
 
 
475 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.01 
 
 
705 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  34.88 
 
 
438 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  32.01 
 
 
402 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.1 
 
 
1241 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 
407 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.1 
 
 
1328 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  30.72 
 
 
455 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  31.65 
 
 
365 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 
412 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.71 
 
 
386 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  27.05 
 
 
556 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  32.01 
 
 
454 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  29.78 
 
 
363 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  25.55 
 
 
422 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.49 
 
 
363 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  34.06 
 
 
546 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  27.6 
 
 
381 aa  100  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.81 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  28.29 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  26.06 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
619 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 
809 aa  97.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 
395 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  27.78 
 
 
395 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 
402 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.35 
 
 
2272 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.77 
 
 
458 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  30.31 
 
 
555 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  27.86 
 
 
1067 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  27.81 
 
 
440 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
797 aa  93.6  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.52 
 
 
386 aa  93.2  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  28.65 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  27.38 
 
 
387 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  28.71 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.72 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.72 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.76 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
643 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.51 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.47 
 
 
392 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
389 aa  90.1  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  30.85 
 
 
422 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.07 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  27.13 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  29.52 
 
 
2036 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.52 
 
 
1969 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.22 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.54 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.47 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.86 
 
 
1300 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.07 
 
 
392 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>