More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1202 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 458 aa  918    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  42.09 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  39.66 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  35.96 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  37.14 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  36.03 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  33.82 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  34.28 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  35.29 
 
 		 448 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  33.55 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  35.29 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  34.37 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  35.54 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  34.1 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  32.39 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  29.72 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  26.29 
 
 		 384 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  26.02 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  28.8 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.65 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.81 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.37 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  25.62 
 
 		 399 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.61 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.61 
 
 		 392 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.61 
 
 		 392 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.61 
 
 		 392 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.84 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.33 
 
 		 392 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.09 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.75 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.75 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.75 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  27.68 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.68 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.68 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.68 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  27.68 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.68 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.4 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.4 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.05 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  29.3 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.76 
 
 		 415 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.14 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  26.85 
 
 		 353 aa  120  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.39 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  29.38 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  28.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.32 
 
 		 385 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.04 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.14 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.95 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 		 392 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.73 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  23.16 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.82 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  26.25 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.82 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  26.76 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  26.76 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  26.76 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.85 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.39 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  23.06 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.66 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  23.83 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  22.8 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.35 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.46 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  27.98 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  27.61 
 
 		 381 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.18 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  23.03 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  23.03 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.01 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.16 
 
 		 386 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  25.9 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 		 389 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.18 
 
 		 396 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.2 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  25.21 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.72 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.18 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>