287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0886 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  99.74 
 
 
380 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
380 aa  754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  97.11 
 
 
380 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  97.11 
 
 
389 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  84.21 
 
 
384 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  83.95 
 
 
381 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  84.74 
 
 
380 aa  614  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  78.78 
 
 
379 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  67.97 
 
 
384 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  71.84 
 
 
380 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  71.58 
 
 
380 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  40.91 
 
 
372 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  41.35 
 
 
389 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  40.53 
 
 
384 aa  269  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  38.02 
 
 
387 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.6 
 
 
395 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  41.94 
 
 
400 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.96 
 
 
385 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.82 
 
 
395 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.56 
 
 
395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.08 
 
 
402 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.91 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.75 
 
 
395 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.31 
 
 
395 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.77 
 
 
411 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.08 
 
 
395 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.08 
 
 
395 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  36 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.82 
 
 
395 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.82 
 
 
395 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.75 
 
 
395 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.2 
 
 
396 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
400 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
400 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  37.47 
 
 
388 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.49 
 
 
395 aa  236  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.31 
 
 
395 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  34.59 
 
 
386 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.23 
 
 
395 aa  232  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.83 
 
 
386 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.01 
 
 
395 aa  230  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  33.5 
 
 
399 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  36.54 
 
 
395 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.46 
 
 
393 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.61 
 
 
392 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  36.91 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  36.21 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.61 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.65 
 
 
415 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  32.01 
 
 
384 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  31.75 
 
 
384 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.46 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.36 
 
 
393 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  35.31 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.43 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.96 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.2 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.53 
 
 
386 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.33 
 
 
381 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  31.73 
 
 
450 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.41 
 
 
393 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  32.23 
 
 
381 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  35.77 
 
 
383 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  37.16 
 
 
390 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  32.23 
 
 
381 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  32.23 
 
 
381 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  32.23 
 
 
381 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.41 
 
 
402 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  31.71 
 
 
386 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.88 
 
 
414 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.44 
 
 
381 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  32.04 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  32.04 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  32.04 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  32.04 
 
 
381 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.77 
 
 
381 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  31.77 
 
 
381 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  35.36 
 
 
380 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.49 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.04 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.01 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  31.77 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.68 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.68 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.68 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  33.87 
 
 
388 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.43 
 
 
385 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.43 
 
 
385 aa  193  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.76 
 
 
392 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.5 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.5 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.5 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.5 
 
 
392 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.23 
 
 
392 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.45 
 
 
392 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  30.18 
 
 
392 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.18 
 
 
392 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  30.18 
 
 
392 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
392 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>