271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1720 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  94.29 
 
 		 381 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  100 
 
 		 350 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  89.14 
 
 		 381 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  88.86 
 
 		 381 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  88.86 
 
 		 381 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  97.71 
 
 		 381 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  89.43 
 
 		 381 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  88.86 
 
 		 381 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  97.43 
 
 		 381 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  99.71 
 
 		 381 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  97.43 
 
 		 381 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  88.86 
 
 		 381 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  88.86 
 
 		 381 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  88.86 
 
 		 381 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  97.71 
 
 		 381 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  80.57 
 
 		 386 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  77.71 
 
 		 386 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  77.71 
 
 		 381 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  51.86 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  52.15 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  48.71 
 
 		 392 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  48.42 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  46.99 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  40.4 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  39.54 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  43.23 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  40.29 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  39.66 
 
 		 385 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  38.22 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  42.69 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  36.89 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  40.46 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  37.07 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.78 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  37.61 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.64 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  37.94 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  34.47 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  36.68 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  33.14 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.92 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.06 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  31.44 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.29 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  33.14 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  32.01 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  33.14 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  35.06 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  32.01 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.36 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  32.18 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  34.28 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.44 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  32.56 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.91 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  33.99 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.82 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  31.83 
 
 		 384 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.04 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.77 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.49 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  33.24 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  33.24 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.05 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  31.05 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.66 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  33.81 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  30.75 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  30.46 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 		 395 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.83 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.58 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.34 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.69 
 
 		 395 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  31.3 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  31.3 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.24 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.47 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.47 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.47 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.75 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  29.03 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  30.81 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.19 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.25 
 
 		 395 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.92 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.63 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>