174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1993 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  58.76 
 
 
387 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  50.82 
 
 
381 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  50.55 
 
 
381 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  52.21 
 
 
379 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  48.51 
 
 
380 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  46.26 
 
 
385 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  48.81 
 
 
397 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  45.23 
 
 
375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  45.23 
 
 
383 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  45.61 
 
 
393 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  34.41 
 
 
392 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  34.05 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.86 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  35.14 
 
 
386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.59 
 
 
386 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  33.87 
 
 
388 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.9 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  35.01 
 
 
381 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.43 
 
 
392 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  34.73 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.06 
 
 
350 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.43 
 
 
392 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  34.36 
 
 
381 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  34.36 
 
 
381 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  34.36 
 
 
381 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  34.36 
 
 
381 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.45 
 
 
381 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  34.48 
 
 
381 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  34.77 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  34.45 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  34.45 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  34.48 
 
 
381 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  34.48 
 
 
381 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  30.32 
 
 
388 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.4 
 
 
385 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  31.53 
 
 
386 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  33.69 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.13 
 
 
380 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  30.99 
 
 
450 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.52 
 
 
385 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  26.98 
 
 
384 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  32.34 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.76 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.3 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.58 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.26 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.26 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  29.97 
 
 
390 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  26.95 
 
 
384 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.35 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 
393 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.2 
 
 
393 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  28.93 
 
 
400 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 
395 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.46 
 
 
395 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.88 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.8 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.88 
 
 
389 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.46 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  27.35 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.15 
 
 
395 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.42 
 
 
395 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.07 
 
 
384 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  27.35 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.36 
 
 
393 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.78 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.89 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.88 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  27.14 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.07 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  27.3 
 
 
381 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.89 
 
 
395 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  26.74 
 
 
380 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  27.02 
 
 
384 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 
372 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 
395 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  26.74 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.89 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.89 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.65 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.89 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.27 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  28.82 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 
392 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 
392 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 
392 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.63 
 
 
395 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.47 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.47 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.2 
 
 
392 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  23.2 
 
 
392 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  23.2 
 
 
392 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.2 
 
 
392 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.2 
 
 
392 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>