143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2865 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  100 
 
 		 387 aa  756    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  58.76 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  44.48 
 
 		 381 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  47.56 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  44.44 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  46.51 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  45.28 
 
 		 379 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  44.41 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  44.89 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  44.63 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  44.48 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  33.42 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  33.95 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.71 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.98 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  34.99 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  34.37 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  32.96 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.68 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  32.68 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  32.68 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.52 
 
 		 350 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.96 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.52 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  33.24 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  33.24 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  33.24 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.06 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.24 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  31.78 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.73 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.95 
 
 		 380 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 		 450 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  32.96 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.9 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.26 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  29.59 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.26 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.5 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.41 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  28.53 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.65 
 
 		 395 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.02 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.07 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.66 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.91 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.91 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.57 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.29 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.28 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.65 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.87 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.42 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  27.58 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.14 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.14 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.42 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  30.31 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.19 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  27.58 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.61 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.01 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.61 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.61 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.7 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.91 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  26.9 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.48 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.27 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  26.5 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.86 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.59 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.91 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  28.41 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  24.93 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  28.12 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.63 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>