212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3387 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  100 
 
 
380 aa  751    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  46.05 
 
 
386 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  45 
 
 
380 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  42 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  40.57 
 
 
386 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  39.47 
 
 
381 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  39.84 
 
 
388 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  38.8 
 
 
392 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  40.57 
 
 
381 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  40.29 
 
 
381 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  40 
 
 
381 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  40 
 
 
381 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  40.29 
 
 
350 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  40.29 
 
 
381 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  40.29 
 
 
381 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  39.34 
 
 
383 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  39.17 
 
 
392 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.43 
 
 
385 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  39.7 
 
 
450 aa  256  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.89 
 
 
392 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  39.14 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  39.43 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  39.14 
 
 
381 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  39.14 
 
 
381 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  39.14 
 
 
381 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  39.14 
 
 
381 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  39.14 
 
 
381 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  39.14 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  35.43 
 
 
388 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  39.63 
 
 
390 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.47 
 
 
380 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  34.93 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  37.16 
 
 
380 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  34.93 
 
 
380 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  37.16 
 
 
380 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.2 
 
 
389 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  34.15 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  34.97 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.67 
 
 
402 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  34.15 
 
 
379 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  34.84 
 
 
384 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
411 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.42 
 
 
411 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  33.33 
 
 
381 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  33.06 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  32.98 
 
 
384 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
400 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
400 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  32.86 
 
 
387 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.76 
 
 
385 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  35.92 
 
 
400 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.68 
 
 
396 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  37.62 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  35.31 
 
 
395 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.64 
 
 
386 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.95 
 
 
395 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  36.19 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  30.79 
 
 
399 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  29.84 
 
 
386 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.94 
 
 
386 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.27 
 
 
384 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  28 
 
 
384 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.18 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.8 
 
 
393 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.87 
 
 
393 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.04 
 
 
393 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.81 
 
 
395 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.74 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.09 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.32 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.32 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.97 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
393 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.48 
 
 
395 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  33.71 
 
 
381 aa  162  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.73 
 
 
375 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.06 
 
 
395 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  32.13 
 
 
369 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.03 
 
 
393 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.03 
 
 
393 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  29.29 
 
 
381 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.76 
 
 
402 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  34.93 
 
 
383 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  31.93 
 
 
381 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.98 
 
 
380 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.24 
 
 
395 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.8 
 
 
395 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
393 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.8 
 
 
395 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.8 
 
 
395 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.8 
 
 
395 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.73 
 
 
392 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.53 
 
 
395 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.56 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.56 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.97 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  27.56 
 
 
392 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.56 
 
 
392 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  27.56 
 
 
392 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>