204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1875 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 381 aa  757    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  80.31 
 
 		 381 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  62.43 
 
 		 379 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  61.39 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  61.48 
 
 		 375 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  58.53 
 
 		 380 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  61.2 
 
 		 383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  59.38 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  54.24 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  50.56 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  45.11 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  40.05 
 
 		 392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  38.13 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  36.76 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.07 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  36.34 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.39 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  38.46 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  38.46 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  38.46 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.11 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  38.18 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.22 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  38.18 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  38.22 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  38.22 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.93 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.01 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.22 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  38.22 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  37.93 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  31.86 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.12 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  32.49 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  28.61 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.69 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  28.42 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  30.62 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.2 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  33.02 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  29.13 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  29.69 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  29.41 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.18 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.98 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  27.95 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.98 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  30.08 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  30.03 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  27.52 
 
 		 380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.98 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  28.8 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  27.35 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  27.35 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  30.35 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.47 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.68 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  26.39 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  25.13 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.19 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  26.96 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  30.79 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.46 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.94 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.83 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.33 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.8 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.33 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.4 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.94 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.5 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.69 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.4 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.5 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.4 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.87 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.2 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.87 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.72 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.2 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>