185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1427 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
385 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  72.78 
 
 
375 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  72.51 
 
 
383 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  59.27 
 
 
381 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  68.27 
 
 
397 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  61.39 
 
 
381 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  60 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  62.33 
 
 
393 aa  441  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  56.62 
 
 
380 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  46.78 
 
 
369 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  47.14 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  38.56 
 
 
392 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  39.95 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  38.6 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  40.8 
 
 
381 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  40.52 
 
 
381 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  40.52 
 
 
381 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  40.52 
 
 
381 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  40.52 
 
 
381 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  40.52 
 
 
381 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  40.23 
 
 
381 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  40.23 
 
 
381 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  40.23 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  40.23 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  39.66 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.33 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.06 
 
 
392 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  40.23 
 
 
381 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  39.66 
 
 
381 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  39.66 
 
 
350 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  39.66 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.42 
 
 
386 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.51 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  38.79 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  35.49 
 
 
386 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.28 
 
 
385 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
388 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.01 
 
 
380 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  32.63 
 
 
390 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  34.67 
 
 
380 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 
372 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  31.84 
 
 
379 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.23 
 
 
384 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.96 
 
 
384 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.62 
 
 
380 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  28.05 
 
 
450 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.35 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  30.08 
 
 
380 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  31.02 
 
 
380 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  30.08 
 
 
380 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  31.02 
 
 
380 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 
385 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  29.03 
 
 
384 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  29.05 
 
 
389 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  29.89 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  29.89 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  27.66 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.3 
 
 
393 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  28.98 
 
 
395 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.3 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.17 
 
 
396 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  32.7 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  30.64 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.29 
 
 
393 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.79 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.79 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.79 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  29.84 
 
 
383 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.18 
 
 
402 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 
381 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  27.17 
 
 
387 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.25 
 
 
386 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.29 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.19 
 
 
392 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.93 
 
 
392 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.93 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.93 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.93 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.93 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.26 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.93 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.93 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.93 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.16 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.38 
 
 
393 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.4 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.13 
 
 
392 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.58 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.13 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.13 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.13 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.65 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.13 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 
399 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.36 
 
 
411 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.82 
 
 
395 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  25.75 
 
 
386 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>