289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1121 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  81.17 
 
 
393 aa  669    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  88.55 
 
 
393 aa  725    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  100 
 
 
393 aa  792    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  81.17 
 
 
393 aa  672    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  74.3 
 
 
393 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  75.57 
 
 
393 aa  617  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  75.57 
 
 
393 aa  617  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  75.32 
 
 
393 aa  614  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  72.97 
 
 
392 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  72.97 
 
 
392 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  72.7 
 
 
392 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  72.97 
 
 
392 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  71.65 
 
 
392 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  71.65 
 
 
392 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  71.65 
 
 
392 aa  565  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  71.65 
 
 
392 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  71.65 
 
 
392 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  70.87 
 
 
392 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  71.65 
 
 
392 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  72.7 
 
 
392 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  71.39 
 
 
392 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  71.13 
 
 
392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  71.13 
 
 
392 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  47.97 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.69 
 
 
386 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  41.93 
 
 
386 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.33 
 
 
385 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.54 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  40.48 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
395 aa  305  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
395 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.72 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
395 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
395 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.12 
 
 
395 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.23 
 
 
395 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.97 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.97 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.97 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
395 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.4 
 
 
411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.66 
 
 
395 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.9 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.81 
 
 
414 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.09 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  36.94 
 
 
372 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  33.96 
 
 
400 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.67 
 
 
411 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  36.93 
 
 
395 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.1 
 
 
380 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.11 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  32.36 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  32.36 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
411 aa  212  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.1 
 
 
389 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 
379 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  33.42 
 
 
380 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  33.7 
 
 
387 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  31.4 
 
 
384 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.11 
 
 
385 aa  205  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  32.09 
 
 
381 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  33.16 
 
 
380 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  32.72 
 
 
384 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  32.46 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  33.16 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  31.02 
 
 
384 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  33.25 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  33.25 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.83 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 
381 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  31.23 
 
 
383 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  29.77 
 
 
386 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  30.96 
 
 
389 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  31.56 
 
 
377 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  29.61 
 
 
384 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  31.03 
 
 
388 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.36 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.15 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.36 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.49 
 
 
350 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  31.61 
 
 
398 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.4 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  31.77 
 
 
381 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.77 
 
 
381 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.77 
 
 
381 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  31.49 
 
 
381 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  31.77 
 
 
381 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  28.87 
 
 
386 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  31.22 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  31.22 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  31.22 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  31.22 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  31.22 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>