More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004346 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  100 
 
 		 386 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  91.19 
 
 		 386 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  69.17 
 
 		 386 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  63.38 
 
 		 385 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  45.45 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  45.45 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  44.16 
 
 		 393 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  44.42 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.9 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  45.45 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.12 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.88 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  43.88 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  43.62 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  43.62 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.35 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  43.62 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.93 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  42.71 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40.69 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.54 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.32 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.13 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.62 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.3 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.34 
 
 		 395 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.56 
 
 		 411 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.07 
 
 		 415 aa  291  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.8 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.06 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.55 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.07 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  33.76 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.18 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.8 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.55 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.55 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.55 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.79 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.86 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  35.69 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  36.58 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  37.91 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  36.1 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.93 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  36 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  35.42 
 
 		 380 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  36 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  35.99 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.37 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  33.15 
 
 		 400 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.25 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  33.7 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  32.88 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.51 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.15 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  31.37 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  32.16 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.2 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.58 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  30.18 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  30.51 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  31.71 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.69 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.44 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  33.14 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  32.19 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.32 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.18 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  33.14 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  30.06 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  33.14 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.19 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.91 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  31.91 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  32.86 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.19 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  29.77 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  29.66 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.79 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  27.53 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  30.95 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.73 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>