278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1547 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  100 
 
 
395 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  79.49 
 
 
395 aa  665    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  87.34 
 
 
395 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.22 
 
 
395 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.96 
 
 
395 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  78.73 
 
 
395 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.96 
 
 
395 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.2 
 
 
395 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.46 
 
 
395 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.46 
 
 
395 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  75.19 
 
 
395 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.2 
 
 
395 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  74.68 
 
 
395 aa  614  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  72.66 
 
 
395 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  68.27 
 
 
411 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  68.35 
 
 
395 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  44.3 
 
 
386 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.62 
 
 
415 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  42.04 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40.15 
 
 
385 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.03 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  39.8 
 
 
399 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.14 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.23 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.46 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
393 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  38.3 
 
 
386 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40.1 
 
 
414 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.69 
 
 
393 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.43 
 
 
392 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.17 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.17 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.17 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.39 
 
 
392 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.91 
 
 
392 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.65 
 
 
392 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  36.65 
 
 
392 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.65 
 
 
392 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  36.65 
 
 
392 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.65 
 
 
392 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.65 
 
 
392 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.65 
 
 
392 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.13 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.65 
 
 
392 aa  259  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.75 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 
379 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  34.59 
 
 
391 aa  233  3e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  35.75 
 
 
380 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  35.75 
 
 
380 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.49 
 
 
389 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  34.7 
 
 
372 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  35.03 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  35.03 
 
 
380 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  34.76 
 
 
381 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  34.49 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  34.09 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  34.76 
 
 
380 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  34.81 
 
 
383 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  32.42 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  34.29 
 
 
392 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.6 
 
 
402 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  32.9 
 
 
389 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  31.54 
 
 
387 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.7 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
400 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
400 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  32.53 
 
 
388 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
411 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.56 
 
 
385 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.41 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.88 
 
 
392 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.35 
 
 
392 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.56 
 
 
396 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  30.37 
 
 
386 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.1 
 
 
381 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  32.15 
 
 
395 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  30.85 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  31.35 
 
 
390 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.38 
 
 
381 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  29.49 
 
 
388 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  32.43 
 
 
383 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  28.95 
 
 
384 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.11 
 
 
384 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  28.92 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.86 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  28.92 
 
 
381 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  28.92 
 
 
381 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  28.92 
 
 
381 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 
381 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 
381 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 
381 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  29.33 
 
 
381 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  29 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  29 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.16 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  29 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  29.27 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>