236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2538 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  85.04 
 
 
386 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  100 
 
 
381 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  97.38 
 
 
386 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  79 
 
 
381 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  78.74 
 
 
381 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  78.48 
 
 
381 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  77.69 
 
 
381 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  78.22 
 
 
381 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  77.69 
 
 
381 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  78.48 
 
 
381 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  78.48 
 
 
381 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  78.48 
 
 
381 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  78.48 
 
 
381 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  78.22 
 
 
381 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  77.43 
 
 
381 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  78.48 
 
 
381 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  78.48 
 
 
381 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  77.71 
 
 
350 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  50.53 
 
 
392 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  49.34 
 
 
383 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  49.86 
 
 
392 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  47.3 
 
 
388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  49.31 
 
 
392 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.96 
 
 
385 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  40.11 
 
 
388 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  42.86 
 
 
386 aa  272  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  40.57 
 
 
380 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  36.07 
 
 
381 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  35.56 
 
 
381 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  36.6 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  38.51 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  39.89 
 
 
390 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  40.62 
 
 
380 aa  225  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  35.62 
 
 
397 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.33 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  37.3 
 
 
383 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.18 
 
 
380 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  34.91 
 
 
379 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  33.05 
 
 
379 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  34.64 
 
 
369 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.44 
 
 
380 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.1 
 
 
385 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  34.43 
 
 
380 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.89 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  31.44 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  34.43 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  31.44 
 
 
380 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.37 
 
 
393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  33.05 
 
 
381 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  31.86 
 
 
387 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.02 
 
 
393 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  32.49 
 
 
384 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  31.82 
 
 
384 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  32.1 
 
 
372 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.8 
 
 
402 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 
400 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 
400 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.17 
 
 
389 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  31.44 
 
 
386 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.41 
 
 
395 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.76 
 
 
393 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
393 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.55 
 
 
396 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.08 
 
 
386 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  31.07 
 
 
384 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  32.21 
 
 
380 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  30.18 
 
 
384 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.32 
 
 
386 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  29.92 
 
 
384 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  32.55 
 
 
400 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.1 
 
 
395 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  33.89 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.4 
 
 
393 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.58 
 
 
395 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.84 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.97 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.58 
 
 
411 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.58 
 
 
395 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.35 
 
 
395 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
393 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
393 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.32 
 
 
395 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
393 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.44 
 
 
387 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.53 
 
 
411 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.5 
 
 
392 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.03 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.03 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.03 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.03 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  31.23 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  31.23 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.23 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.23 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.23 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.23 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.71 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.23 
 
 
392 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>