274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2374 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
450 aa  904    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  45.15 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  40.78 
 
 
386 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  38.79 
 
 
388 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  43.09 
 
 
380 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.61 
 
 
392 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.61 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  36.67 
 
 
392 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  39.7 
 
 
380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  37.11 
 
 
383 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.33 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  36.72 
 
 
381 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.44 
 
 
381 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  36.6 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.6 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  36.44 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.89 
 
 
350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  36.44 
 
 
381 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  36.44 
 
 
381 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.16 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  36.89 
 
 
381 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  36.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  38.46 
 
 
372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  35.95 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  36.23 
 
 
388 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.53 
 
 
385 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  32.67 
 
 
380 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.01 
 
 
380 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.29 
 
 
389 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  31.73 
 
 
380 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  31.73 
 
 
380 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  31.25 
 
 
381 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  38.36 
 
 
383 aa  203  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  30.11 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  33.9 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  33.9 
 
 
380 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  30.51 
 
 
386 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.24 
 
 
402 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.36 
 
 
386 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.83 
 
 
411 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  32.32 
 
 
387 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.64 
 
 
386 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  36.49 
 
 
400 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  33.23 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.97 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  28.61 
 
 
384 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  31.53 
 
 
384 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.72 
 
 
402 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 
381 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  28.61 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.49 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.19 
 
 
392 aa  173  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 
393 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.83 
 
 
396 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.76 
 
 
392 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  33.21 
 
 
395 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.81 
 
 
395 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.23 
 
 
392 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  28.23 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  28.23 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.44 
 
 
393 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.96 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.51 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.96 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.23 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.96 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.69 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.96 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 
392 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  30.15 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  30.99 
 
 
379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.11 
 
 
392 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.99 
 
 
395 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  33.1 
 
 
415 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  31.99 
 
 
395 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
400 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
400 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.15 
 
 
395 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.45 
 
 
411 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.41 
 
 
395 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.45 
 
 
395 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.98 
 
 
385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.62 
 
 
395 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 
397 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>