197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2304 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 379 aa  742    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  64.12 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  62.43 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  60 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  62.91 
 
 		 375 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  64.2 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  60.61 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  61.08 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  58.45 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  52.82 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2865  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  45.76 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  39.58 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  38.93 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  38.06 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  38.06 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  38.06 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  36.68 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  37.78 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  38.16 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  37.88 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  37.88 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.39 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.7 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.96 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  37.6 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  36.96 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  36.96 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.65 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.38 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.91 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.68 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  34.91 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  36.68 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  36.96 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.05 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  32.17 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  30.99 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  30.17 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.32 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  27.79 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.51 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  31.12 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  31.35 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  31.09 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.23 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  29.1 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.97 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  30.62 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  25.87 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  28.53 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.81 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  30.59 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  29.1 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  28.77 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  29.1 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.92 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  28.49 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.97 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.6 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  29.1 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.18 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  29.1 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.4 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.32 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  25.24 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.48 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  28.43 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.74 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.07 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.07 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.54 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  26.87 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.8 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.66 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.28 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.56 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.56 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.85 
 
 		 402 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.06 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.06 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.06 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.06 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>