249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2204 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
444 aa  884    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  60 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  51.92 
 
 
444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  37.64 
 
 
461 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  36.45 
 
 
455 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  33.75 
 
 
475 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  33.82 
 
 
458 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  32.99 
 
 
454 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  33.04 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  31.73 
 
 
448 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  32.39 
 
 
447 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  31.47 
 
 
454 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  30.53 
 
 
450 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  32.03 
 
 
453 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  31.9 
 
 
440 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.32 
 
 
441 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.34 
 
 
392 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.34 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.34 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.34 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.34 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  31.34 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.34 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.34 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.34 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  31.34 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.04 
 
 
392 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.34 
 
 
392 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.04 
 
 
392 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.04 
 
 
392 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.45 
 
 
393 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.16 
 
 
392 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.89 
 
 
393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.49 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.77 
 
 
393 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.69 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.58 
 
 
393 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.58 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.58 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.74 
 
 
391 aa  138  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 
387 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  24.36 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 
386 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  30.14 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  25.99 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.14 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.24 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.47 
 
 
385 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.74 
 
 
402 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 
389 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.51 
 
 
395 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.2 
 
 
396 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  23.42 
 
 
386 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 
381 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.04 
 
 
392 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.03 
 
 
384 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 
395 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.86 
 
 
395 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.74 
 
 
384 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 
395 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.03 
 
 
414 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 
395 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.6 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.6 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 
395 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.21 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  21.26 
 
 
389 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.86 
 
 
386 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.21 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  23.33 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.21 
 
 
395 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.21 
 
 
395 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 
402 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.94 
 
 
386 aa  97.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.46 
 
 
395 aa  96.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 
398 aa  93.6  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
400 aa  93.2  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.71 
 
 
395 aa  93.2  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
400 aa  93.2  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0522  quino protein  20.69 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  26.01 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.37 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  23.03 
 
 
384 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
963 aa  89.7  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.44 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.21 
 
 
411 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  23.23 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.45 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  26.69 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.81 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  22.29 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  24.56 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>