266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3622 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  82.23 
 
 		 422 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 422 aa  845    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  44.7 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  32.3 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  32.15 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.03 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.14 
 
 		 1454 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 687 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  35.9 
 
 		 901 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  29.6 
 
 		 653 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 963 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.84 
 
 		 611 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.04 
 
 		 352 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 652 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 		 795 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  30.96 
 
 		 365 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25.87 
 
 		 556 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.44 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.08 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.27 
 
 		 2272 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.06 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.8 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.38 
 
 		 616 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  26.47 
 
 		 1241 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  26.47 
 
 		 1328 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1067 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  27.72 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 643 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  24.34 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  30.05 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  23.16 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.97 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.71 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  24.63 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.58 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.67 
 
 		 1812 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.01 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  27.21 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.56 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  26.2 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.15 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  27.53 
 
 		 448 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  22.22 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.05 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  33.14 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  29.26 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.47 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.68 
 
 		 1383 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  21.44 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  28.28 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  26.93 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  24.84 
 
 		 1300 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  26.38 
 
 		 1009 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1682 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.01 
 
 		 2036 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.01 
 
 		 1969 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.59 
 
 		 797 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  22.42 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.44 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  26.89 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.42 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  32.62 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 861 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0522  quino protein  25.31 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  38.6 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.57 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.41 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.57 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  28.11 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.91 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  31.68 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  22.07 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  22.69 
 
 		 499 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  22.69 
 
 		 499 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  26.88 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 		 380 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  24.05 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>