292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1643 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
457 aa  899    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  33.94 
 
 
431 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
687 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  37.08 
 
 
352 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
415 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 
963 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  35.69 
 
 
1454 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
795 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  34.93 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
652 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  30.5 
 
 
653 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.46 
 
 
1682 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 
484 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  31.99 
 
 
324 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  32.29 
 
 
322 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  32.08 
 
 
322 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  31.97 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.04 
 
 
423 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 
774 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.91 
 
 
2122 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  35.57 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  33.21 
 
 
901 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.42 
 
 
514 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  28.03 
 
 
432 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.74 
 
 
365 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.49 
 
 
445 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.76 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  32.38 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28.14 
 
 
371 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  32.38 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
611 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 
705 aa  90.9  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  29.03 
 
 
382 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  26.71 
 
 
445 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 
383 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  31.27 
 
 
534 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.48 
 
 
374 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  29.24 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.37 
 
 
1812 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  27.43 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  29.32 
 
 
363 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 
603 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.24 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.68 
 
 
797 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  28.45 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 
619 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
616 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  25.68 
 
 
603 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.65 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.36 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.42 
 
 
393 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  26.47 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  22.93 
 
 
611 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.7 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  27.31 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  27.93 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  27.4 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.1 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.1 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.1 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  26.92 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.26 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.76 
 
 
2272 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  28.75 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.36 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.45 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.49 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.42 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.43 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.43 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  25.16 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.01 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.95 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  27.56 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.53 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.53 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.53 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.53 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  24.73 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.32 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  28.09 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
861 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  27 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  22.05 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>