170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1531 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 546 aa  1085    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  33.22 
 
 		 2122 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1682 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  30.87 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  30.32 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  29.82 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  30.13 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.43 
 
 		 1383 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  35.34 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 963 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.45 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  23.28 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  31.18 
 
 		 653 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  32.34 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 687 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 652 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  34.06 
 
 		 463 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  31.03 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 774 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  30.59 
 
 		 432 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  31.48 
 
 		 484 aa  93.6  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  31.66 
 
 		 475 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 795 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.79 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  28.02 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  27.96 
 
 		 603 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.23 
 
 		 1454 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  31.84 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  30.82 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.29 
 
 		 1812 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  32.74 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 611 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  32.61 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  26.62 
 
 		 408 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.64 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  30.63 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 611 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.45 
 
 		 383 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  31.79 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.57 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  30.7 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.14 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  32.63 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  28.32 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  29.13 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26.62 
 
 		 372 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.67 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  26.38 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  28.79 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.69 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.69 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  26.87 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4237  Pyrrolo-quinoline quinone  28.06 
 
 		 588 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000286239  hitchhiker  0.000138853 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  28.5 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  29.95 
 
 		 363 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  28.5 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  26.27 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0591  hypothetical protein  33.93 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  21.43 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  28.9 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  26.04 
 
 		 726 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1890  Pyrrolo-quinoline quinone  31.2 
 
 		 552 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  26.2 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.31 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  32.31 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  32.31 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.82 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.31 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  28.57 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.34 
 
 		 1072 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2616  WD40 repeat, subgroup  32 
 
 		 145 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173979  normal  0.948356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.91 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 454 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.34 
 
 		 1072 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.68 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  22.76 
 
 		 440 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.79 
 
 		 386 aa  51.2  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 381 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.5 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.5 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.5 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.5 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.32 
 
 		 385 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  35.04 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  29.17 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  32.79 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.27 
 
 		 391 aa  49.7  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>