206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1899 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
398 aa  805    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  52.97 
 
 
387 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  52.45 
 
 
402 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.61 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.87 
 
 
393 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  31.64 
 
 
372 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.33 
 
 
393 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.81 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  28.25 
 
 
399 aa  169  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 
393 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 
393 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 
393 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.74 
 
 
392 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.74 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.7 
 
 
381 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  29.47 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.47 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.47 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.47 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  29.47 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.47 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  29.18 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  31.25 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  31.25 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.47 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.21 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.54 
 
 
381 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  29.43 
 
 
400 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.37 
 
 
386 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  31.03 
 
 
386 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 
392 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  30.62 
 
 
386 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  31.56 
 
 
379 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  33.14 
 
 
380 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
392 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
392 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
392 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.18 
 
 
392 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  29.35 
 
 
388 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.7 
 
 
380 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  32.28 
 
 
381 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  31.76 
 
 
380 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.91 
 
 
381 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  32.91 
 
 
381 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  32.91 
 
 
381 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.28 
 
 
350 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  31.76 
 
 
380 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.36 
 
 
385 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.59 
 
 
381 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.42 
 
 
395 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.92 
 
 
392 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  29.07 
 
 
384 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  28.8 
 
 
384 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  29.53 
 
 
380 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.09 
 
 
385 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  29.12 
 
 
387 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.31 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  29.92 
 
 
383 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
392 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  30.29 
 
 
381 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  32.96 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  30.38 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  30.29 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  30.29 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  32.96 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  30.29 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  28.74 
 
 
380 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  28.74 
 
 
380 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
395 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.95 
 
 
392 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  32.59 
 
 
381 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.95 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  30.98 
 
 
386 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  29.15 
 
 
389 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.65 
 
 
395 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30 
 
 
396 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.52 
 
 
386 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  29.69 
 
 
384 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.65 
 
 
395 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.54 
 
 
380 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.39 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.78 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.34 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.74 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
411 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.26 
 
 
411 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.18 
 
 
411 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  29.01 
 
 
395 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 
395 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  33.19 
 
 
377 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.77 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.77 
 
 
395 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.77 
 
 
395 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  29.01 
 
 
450 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
381 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.54 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.51 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>