30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1743 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  819    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  29.33 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  31.16 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.48 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1682 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.31 
 
 		 322 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.03 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.29 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  26.82 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.39 
 
 		 2122 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 		 546 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25 
 
 		 1812 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.41 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.71 
 
 		 774 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  23.91 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.16 
 
 		 1383 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.85 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.69 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  21.56 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 652 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  31.65 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  31.65 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 820 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.82 
 
 		 687 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.88 
 
 		 653 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 963 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.53 
 
 		 1241 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>