148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4961 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 440 aa  856    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.92 
 
 		 1682 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  37.05 
 
 		 322 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.85 
 
 		 2122 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  37.05 
 
 		 322 aa  230  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  37.24 
 
 		 322 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  36.64 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  38.42 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.31 
 
 		 1383 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  36.56 
 
 		 431 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 963 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  30.32 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  35.44 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  32.6 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  33.78 
 
 		 423 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 		 687 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  33.22 
 
 		 653 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 		 652 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  34.71 
 
 		 463 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  36.8 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  35.17 
 
 		 795 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  35.46 
 
 		 1454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  32.9 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 774 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  29.75 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  35.6 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.95 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  31.34 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.26 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.8 
 
 		 1812 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  34.35 
 
 		 901 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  29.62 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  24.92 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  30.48 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 		 603 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  29.46 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 603 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  26.82 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28.96 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 848 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  23.96 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 619 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.62 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  24.75 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  25.52 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.85 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  34.13 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.07 
 
 		 402 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  20.17 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  26.41 
 
 		 1735 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  21.87 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  22.07 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  22.91 
 
 		 2036 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  24.76 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  27.18 
 
 		 797 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  31.62 
 
 		 616 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  30.4 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  26.28 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  23.1 
 
 		 834 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.68 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  27.68 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1890  Pyrrolo-quinoline quinone  25.78 
 
 		 552 aa  49.7  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.12 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.34 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  23.15 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0806  Pyrrolo-quinoline quinone  28.31 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7435  hypothetical protein  27.88 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4046  hypothetical protein  27.88 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00161846  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  28.51 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  32.06 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  24.41 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.33 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  29.3 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.33 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2698  hypothetical protein  29.91 
 
 		 547 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.744125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  29.19 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.49 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.49 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.03 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  25.24 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>