13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1890 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1890  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 552 aa  1082    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0591  hypothetical protein  30.08 
 
 		 613 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  22.95 
 
 		 603 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  22.28 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  31.2 
 
 		 546 aa  54.7  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  28.95 
 
 		 387 aa  51.2  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  25.78 
 
 		 440 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.41 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.68 
 
 		 2122 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.35 
 
 		 652 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  29.91 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 795 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>