184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1549 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 656 aa  1337    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  50.7 
 
 		 2036 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.92 
 
 		 1328 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  45.71 
 
 		 1241 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  40.66 
 
 		 612 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.55 
 
 		 1969 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  36.95 
 
 		 1311 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.97 
 
 		 1842 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  35.29 
 
 		 2272 aa  252  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  38.24 
 
 		 635 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  34.57 
 
 		 809 aa  223  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  38.48 
 
 		 626 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  34.82 
 
 		 834 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1067 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  30.07 
 
 		 797 aa  197  7e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.44 
 
 		 1009 aa  193  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  31.7 
 
 		 430 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  31.21 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  40.09 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  37.78 
 
 		 771 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  35.71 
 
 		 940 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  39.8 
 
 		 416 aa  127  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1096 aa  127  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  35.89 
 
 		 525 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  35.45 
 
 		 405 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  37.44 
 
 		 747 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  37.09 
 
 		 635 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  33.61 
 
 		 861 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  38.75 
 
 		 418 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  32.77 
 
 		 1021 aa  111  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  32.54 
 
 		 631 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  29.65 
 
 		 373 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  30.28 
 
 		 656 aa  91.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  25.58 
 
 		 1533 aa  88.6  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  32.06 
 
 		 926 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  33.97 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  25.84 
 
 		 645 aa  82.8  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  22.97 
 
 		 1812 aa  76.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  33.53 
 
 		 2552 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 652 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  21.21 
 
 		 774 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.68 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0991  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 		 1261 aa  70.9  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.620303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  40.37 
 
 		 168 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.48 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  21.43 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  36.21 
 
 		 1351 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.46 
 
 		 432 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  22.4 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  23.27 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  22.76 
 
 		 963 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.19 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  19.85 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  23.43 
 
 		 1454 aa  58.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1682 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  22.96 
 
 		 463 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  21.9 
 
 		 619 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  20.94 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  25.61 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.56 
 
 		 616 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  23.5 
 
 		 322 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.88 
 
 		 387 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  25.6 
 
 		 1783 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  23.67 
 
 		 457 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32.35 
 
 		 1279 aa  55.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 		 558 aa  54.7  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3700  Pyrrolo-quinoline quinone  32.76 
 
 		 154 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 445 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  21.82 
 
 		 705 aa  54.3  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  25.95 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.42 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.49 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.99 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  22.9 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.29 
 
 		 352 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.1 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.1 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  19.43 
 
 		 381 aa  52.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  19.12 
 
 		 611 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  20.26 
 
 		 396 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  22.86 
 
 		 705 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.36 
 
 		 383 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 		 386 aa  51.2  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 		 441 aa  51.2  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  23.44 
 
 		 475 aa  50.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  25.81 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 		 450 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 		 382 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 		 406 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  23.63 
 
 		 718 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.43 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  24.8 
 
 		 390 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  24.67 
 
 		 613 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>