22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04620 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  100 
 
 		 1533 aa  3094    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0991  Pyrrolo-quinoline quinone  39.58 
 
 		 1261 aa  408  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.620303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.82 
 
 		 2036 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.18 
 
 		 1842 aa  99.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  31.23 
 
 		 430 aa  95.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 656 aa  91.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  25.46 
 
 		 1328 aa  89.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.23 
 
 		 1241 aa  89  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  26.63 
 
 		 1009 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1067 aa  79.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  23.26 
 
 		 1311 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  27.54 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  27.33 
 
 		 834 aa  72.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.33 
 
 		 1969 aa  71.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  24.42 
 
 		 2272 aa  68.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 484 aa  63.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  27.34 
 
 		 612 aa  63.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  26.6 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  21.72 
 
 		 797 aa  53.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  27.09 
 
 		 626 aa  52.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1548  hypothetical protein  28.02 
 
 		 534 aa  52  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  26.29 
 
 		 3320 aa  48.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>