23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1801 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  62.98 
 
 
635 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1264    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  56.56 
 
 
612 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  37.23 
 
 
1241 aa  229  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  37.23 
 
 
656 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  37.02 
 
 
1328 aa  223  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  38.82 
 
 
2036 aa  223  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.49 
 
 
1842 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  32.46 
 
 
1311 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.37 
 
 
1969 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.98 
 
 
1009 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.38 
 
 
2272 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  31.96 
 
 
1067 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  29.44 
 
 
834 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  31.22 
 
 
430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  31.62 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.72 
 
 
797 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  30.54 
 
 
809 aa  132  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  26.98 
 
 
1533 aa  52.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.04 
 
 
1300 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  35.46 
 
 
1812 aa  50.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  42.22 
 
 
556 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
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NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 
431 aa  44.3  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
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