28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1992 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  62.15 
 
 		 635 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1237    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  56.88 
 
 		 626 aa  581  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  46.56 
 
 		 2036 aa  320  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.18 
 
 		 1241 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  40.71 
 
 		 1328 aa  289  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  40.66 
 
 		 656 aa  277  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.1 
 
 		 1842 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.09 
 
 		 1969 aa  193  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  36.32 
 
 		 2272 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  35.64 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  33.4 
 
 		 1311 aa  190  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1067 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.43 
 
 		 1009 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  33.1 
 
 		 809 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  30.19 
 
 		 834 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  31 
 
 		 797 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  31.58 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  37.96 
 
 		 1812 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  32.69 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  27.17 
 
 		 1533 aa  63.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25.22 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 		 431 aa  47.4  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.69 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  24.31 
 
 		 1300 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1682 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  49.02 
 
 		 653 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 		 422 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>