More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1794 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  100 
 
 		 1328 aa  2674    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  48.94 
 
 		 2036 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  61.15 
 
 		 1241 aa  1167    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  44.44 
 
 		 1311 aa  984    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  50.75 
 
 		 1300 aa  572  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  47.48 
 
 		 1969 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.25 
 
 		 1842 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  45.33 
 
 		 2272 aa  380  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  47.34 
 
 		 656 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  40.93 
 
 		 612 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  40.66 
 
 		 797 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  36.46 
 
 		 556 aa  283  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.95 
 
 		 2122 aa  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1067 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  40.55 
 
 		 635 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  37.94 
 
 		 809 aa  233  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.27 
 
 		 1682 aa  230  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  37.44 
 
 		 497 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  37.12 
 
 		 626 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  60 
 
 		 1882 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  55.98 
 
 		 2000 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  33.96 
 
 		 834 aa  193  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.81 
 
 		 1009 aa  191  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  58.29 
 
 		 978 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.49 
 
 		 3295 aa  174  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  57.31 
 
 		 1120 aa  172  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  55.31 
 
 		 575 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  50.82 
 
 		 1732 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  31.78 
 
 		 484 aa  164  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  53.71 
 
 		 1094 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.3 
 
 		 2554 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  52.87 
 
 		 1667 aa  158  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  52.98 
 
 		 752 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  51.11 
 
 		 658 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  54.55 
 
 		 791 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  31.06 
 
 		 430 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  52.35 
 
 		 963 aa  155  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  52.6 
 
 		 1282 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.95 
 
 		 735 aa  155  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  54.37 
 
 		 581 aa  154  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  51.18 
 
 		 551 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  47.03 
 
 		 679 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.1 
 
 		 669 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  52 
 
 		 560 aa  153  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  50.86 
 
 		 910 aa  152  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  50.87 
 
 		 184 aa  151  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.62 
 
 		 615 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  42.42 
 
 		 713 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  47.74 
 
 		 561 aa  149  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  50.29 
 
 		 644 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  51.74 
 
 		 547 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  45.23 
 
 		 1361 aa  145  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  49.14 
 
 		 675 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  48.82 
 
 		 859 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  50.29 
 
 		 1236 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  47.98 
 
 		 1356 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  45.67 
 
 		 1862 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  50.85 
 
 		 685 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  47.46 
 
 		 528 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  47.09 
 
 		 519 aa  142  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  45.45 
 
 		 1231 aa  141  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  51.76 
 
 		 816 aa  138  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  46.96 
 
 		 996 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.09 
 
 		 930 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  43.82 
 
 		 530 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.45 
 
 		 941 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  46.55 
 
 		 460 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.21 
 
 		 861 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.59 
 
 		 1812 aa  129  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  43.02 
 
 		 838 aa  126  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  41.62 
 
 		 960 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.68 
 
 		 845 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  38.57 
 
 		 848 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.07 
 
 		 958 aa  121  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.68 
 
 		 1528 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.12 
 
 		 930 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  43.35 
 
 		 1531 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  41.34 
 
 		 500 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  39.89 
 
 		 1001 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  44.12 
 
 		 1931 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.66 
 
 		 802 aa  116  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  47.74 
 
 		 1667 aa  115  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  28.47 
 
 		 819 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  41.3 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.83 
 
 		 971 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.57 
 
 		 870 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  49.03 
 
 		 840 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  39.11 
 
 		 439 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  41.52 
 
 		 400 aa  112  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 1380 aa  112  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  42.59 
 
 		 684 aa  112  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.39 
 
 		 1095 aa  109  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  45.06 
 
 		 1783 aa  108  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.86 
 
 		 869 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.77 
 
 		 819 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  46.67 
 
 		 1387 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.52 
 
 		 823 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.1 
 
 		 463 aa  107  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.63 
 
 		 940 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  39.89 
 
 		 719 aa  105  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>