192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3733 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  100 
 
 
1067 aa  2181    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  54.45 
 
 
809 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  45.2 
 
 
2036 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  44.34 
 
 
1969 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.03 
 
 
2272 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  39.72 
 
 
797 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  41.05 
 
 
834 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40.3 
 
 
1300 aa  264  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  33.55 
 
 
1328 aa  261  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  33.77 
 
 
1311 aa  251  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  37.32 
 
 
1241 aa  232  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  34.12 
 
 
556 aa  232  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
656 aa  208  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.46 
 
 
1009 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  32.87 
 
 
497 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  36.44 
 
 
1842 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  33.49 
 
 
612 aa  173  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  31.74 
 
 
626 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  30 
 
 
430 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  27.36 
 
 
484 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
687 aa  97.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 
463 aa  94.7  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.8 
 
 
1812 aa  91.3  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.35 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
795 aa  82.8  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  24.19 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  24.19 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
382 aa  80.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  28.43 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.13 
 
 
415 aa  79  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.14 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  26.65 
 
 
1533 aa  78.2  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  23.02 
 
 
455 aa  76.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 
963 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
475 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  25.07 
 
 
774 aa  74.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  23.96 
 
 
448 aa  70.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  21.79 
 
 
407 aa  70.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  25.64 
 
 
450 aa  70.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.25 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  23.92 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  23.51 
 
 
1454 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  20.86 
 
 
374 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.27 
 
 
653 aa  66.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 
422 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  21.78 
 
 
448 aa  65.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  25.25 
 
 
422 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.92 
 
 
393 aa  65.1  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
611 aa  65.1  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.59 
 
 
392 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.59 
 
 
392 aa  62.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.59 
 
 
392 aa  62.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.12 
 
 
392 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.59 
 
 
392 aa  62.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.08 
 
 
393 aa  61.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.75 
 
 
393 aa  60.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 
445 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.44 
 
 
392 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.55 
 
 
2122 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  30.56 
 
 
2000 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  22.57 
 
 
445 aa  59.7  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.15 
 
 
392 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.15 
 
 
392 aa  58.9  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.71 
 
 
392 aa  58.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
453 aa  58.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  24.51 
 
 
457 aa  58.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.28 
 
 
402 aa  58.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.85 
 
 
392 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.85 
 
 
392 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.7 
 
 
461 aa  57.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.85 
 
 
392 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.85 
 
 
392 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  31.07 
 
 
611 aa  57.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.85 
 
 
392 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  24.45 
 
 
444 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.85 
 
 
392 aa  57  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  23.97 
 
 
861 aa  56.2  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.48 
 
 
393 aa  56.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 
397 aa  55.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.91 
 
 
385 aa  55.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
616 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  21.72 
 
 
387 aa  54.7  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  22.49 
 
 
402 aa  54.3  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  18.24 
 
 
396 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  23.19 
 
 
1238 aa  54.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.94 
 
 
411 aa  54.3  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.34 
 
 
402 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  32.62 
 
 
412 aa  53.5  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  20.5 
 
 
399 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 
705 aa  53.5  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.22 
 
 
393 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.22 
 
 
393 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>