70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3735 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  100 
 
 
430 aa  840    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  31.7 
 
 
656 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  31.06 
 
 
1328 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  30.84 
 
 
1241 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.57 
 
 
1842 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.76 
 
 
2036 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  34.01 
 
 
484 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  31.56 
 
 
626 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  31.58 
 
 
612 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  30 
 
 
1067 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  27.87 
 
 
797 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  28.77 
 
 
809 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  28.81 
 
 
1969 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.08 
 
 
1009 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  30.2 
 
 
635 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.53 
 
 
2272 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.83 
 
 
834 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  31.35 
 
 
1533 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.34 
 
 
1311 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.14 
 
 
445 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  23.97 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.17 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0991  Pyrrolo-quinoline quinone  24.59 
 
 
1261 aa  56.2  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.620303  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  20.84 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  29.44 
 
 
450 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  23.6 
 
 
463 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
436 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  23.22 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.33 
 
 
653 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
652 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.21 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
687 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02746  polyvinylalcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
561 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  22.33 
 
 
1812 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.24 
 
 
371 aa  47  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
795 aa  46.6  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  21.74 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  26.26 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.48 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  24.31 
 
 
934 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  26.26 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.14 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  22.76 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.56 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.42 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.24 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  27.53 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.4 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  25.83 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  25.83 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2085  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
569 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.83 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.71 
 
 
384 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
820 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  22.77 
 
 
374 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.71 
 
 
384 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  24.19 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.49 
 
 
389 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  27.53 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  22.6 
 
 
471 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  21.29 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.43 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 
432 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  25.53 
 
 
580 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  25.16 
 
 
384 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>