More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1800 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  51.27 
 
 		 1094 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  66.03 
 
 		 1300 aa  923    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  100 
 
 		 2272 aa  4598    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  72.62 
 
 		 2036 aa  2349    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  73.36 
 
 		 1842 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  72.49 
 
 		 1969 aa  2214    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  78.09 
 
 		 1882 aa  658    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  90.78 
 
 		 2122 aa  751    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  84.21 
 
 		 2000 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.26 
 
 		 1667 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  78.2 
 
 		 978 aa  797    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  81.79 
 
 		 1682 aa  948    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  84.05 
 
 		 575 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  46.69 
 
 		 1862 aa  635  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.86 
 
 		 1241 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  46.33 
 
 		 1361 aa  589  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  80.87 
 
 		 1120 aa  583  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  62.18 
 
 		 561 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  65.94 
 
 		 752 aa  512  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.09 
 
 		 963 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.22 
 
 		 941 aa  477  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  49.31 
 
 		 1356 aa  476  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.66 
 
 		 2554 aa  474  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  43.07 
 
 		 1282 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  60.9 
 
 		 713 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  55.64 
 
 		 809 aa  459  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  44.64 
 
 		 1667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  65.8 
 
 		 679 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  57.34 
 
 		 735 aa  447  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  68.98 
 
 		 685 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.07 
 
 		 1387 aa  444  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  68.29 
 
 		 675 aa  436  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  69.23 
 
 		 658 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  65.77 
 
 		 669 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  67.48 
 
 		 859 aa  427  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  86.07 
 
 		 547 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  35.11 
 
 		 1528 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  44.83 
 
 		 1236 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1067 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  76.71 
 
 		 791 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  37.94 
 
 		 1783 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.33 
 
 		 1328 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  73.91 
 
 		 581 aa  374  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.17 
 
 		 528 aa  367  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  74.9 
 
 		 551 aa  360  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  45.11 
 
 		 930 aa  355  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.03 
 
 		 530 aa  349  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  40.29 
 
 		 838 aa  347  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.26 
 
 		 2176 aa  339  3.9999999999999995e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  44.75 
 
 		 1311 aa  336  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.67 
 
 		 952 aa  323  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  42.05 
 
 		 834 aa  322  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  34.05 
 
 		 1814 aa  321  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  35.06 
 
 		 1011 aa  314  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  63.71 
 
 		 615 aa  313  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  41.97 
 
 		 958 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  40.55 
 
 		 797 aa  304  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.46 
 
 		 460 aa  296  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.83 
 
 		 1732 aa  292  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  60.47 
 
 		 3295 aa  288  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  38.14 
 
 		 556 aa  280  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.68 
 
 		 910 aa  268  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  76.37 
 
 		 184 aa  266  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.53 
 
 		 1606 aa  260  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  48.05 
 
 		 861 aa  258  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  30.48 
 
 		 865 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  36.43 
 
 		 656 aa  248  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  33.29 
 
 		 1602 aa  247  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.64 
 
 		 869 aa  243  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.93 
 
 		 971 aa  242  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  58.41 
 
 		 560 aa  241  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  40.67 
 
 		 497 aa  236  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.53 
 
 		 1620 aa  234  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.74 
 
 		 1292 aa  233  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  68.71 
 
 		 644 aa  228  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.19 
 
 		 840 aa  223  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  36.64 
 
 		 823 aa  223  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.87 
 
 		 1009 aa  220  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.36 
 
 		 719 aa  214  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  40.65 
 
 		 802 aa  213  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  40.16 
 
 		 443 aa  213  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  37.74 
 
 		 870 aa  210  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.24 
 
 		 930 aa  204  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.76 
 
 		 845 aa  200  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.52 
 
 		 938 aa  195  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.9 
 
 		 2552 aa  193  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  36.32 
 
 		 612 aa  192  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.22 
 
 		 786 aa  192  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.21 
 
 		 1531 aa  191  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.64 
 
 		 929 aa  189  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 1987 aa  186  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 819 aa  185  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 635 aa  181  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.13 
 
 		 777 aa  181  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.79 
 
 		 1095 aa  181  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.03 
 
 		 439 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  32.93 
 
 		 1380 aa  176  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  31.32 
 
 		 734 aa  174  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  48.17 
 
 		 519 aa  167  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.53 
 
 		 1189 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>