More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3737 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  81.79 
 
 		 2272 aa  947    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  79.24 
 
 		 2036 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  76.62 
 
 		 1842 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  80.24 
 
 		 1882 aa  661    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  85.34 
 
 		 2122 aa  707    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  83.37 
 
 		 2000 aa  716    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  74.41 
 
 		 978 aa  1396    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  100 
 
 		 1682 aa  3377    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  83.85 
 
 		 575 aa  700    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  63.95 
 
 		 561 aa  592  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  54.21 
 
 		 1094 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  86.75 
 
 		 1969 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  81.48 
 
 		 1120 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  85.24 
 
 		 1300 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  51.48 
 
 		 1667 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  81.82 
 
 		 1241 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  48.7 
 
 		 1361 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  66.91 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.5 
 
 		 1862 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  46.61 
 
 		 963 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  43.73 
 
 		 1282 aa  483  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  71.39 
 
 		 685 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  57.73 
 
 		 735 aa  466  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  61 
 
 		 713 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  67.05 
 
 		 679 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  70.21 
 
 		 675 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  67.36 
 
 		 669 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.79 
 
 		 941 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  69.82 
 
 		 658 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  66.77 
 
 		 859 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  53.83 
 
 		 1356 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  84.43 
 
 		 547 aa  414  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  77.91 
 
 		 791 aa  390  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.29 
 
 		 1667 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.48 
 
 		 930 aa  387  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  75.1 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  48.12 
 
 		 2554 aa  383  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  44.18 
 
 		 1236 aa  377  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.13 
 
 		 1387 aa  373  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  67.44 
 
 		 551 aa  370  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.23 
 
 		 838 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  49.12 
 
 		 528 aa  370  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.67 
 
 		 530 aa  348  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.9 
 
 		 1528 aa  335  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.72 
 
 		 958 aa  332  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  66.13 
 
 		 615 aa  325  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  37.01 
 
 		 1783 aa  323  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  49.56 
 
 		 460 aa  298  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.23 
 
 		 1011 aa  289  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.97 
 
 		 1814 aa  283  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.9 
 
 		 2176 aa  278  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  46.82 
 
 		 322 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  56.08 
 
 		 3295 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  34.28 
 
 		 952 aa  275  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  45.86 
 
 		 322 aa  273  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  46.18 
 
 		 322 aa  273  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  56.47 
 
 		 1732 aa  272  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  51.19 
 
 		 910 aa  271  7e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  79.07 
 
 		 184 aa  271  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  46.01 
 
 		 324 aa  268  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  49.85 
 
 		 861 aa  267  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  54.31 
 
 		 486 aa  266  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.22 
 
 		 865 aa  261  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  38.92 
 
 		 440 aa  255  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.93 
 
 		 1383 aa  254  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.87 
 
 		 869 aa  250  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  70.69 
 
 		 560 aa  243  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.44 
 
 		 971 aa  243  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.83 
 
 		 1292 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  71.17 
 
 		 644 aa  235  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  34.85 
 
 		 1328 aa  230  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  48.05 
 
 		 930 aa  220  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.91 
 
 		 443 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.47 
 
 		 823 aa  217  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.37 
 
 		 840 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.08 
 
 		 1606 aa  212  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  39.33 
 
 		 431 aa  211  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.24 
 
 		 1620 aa  211  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.06 
 
 		 719 aa  208  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.62 
 
 		 1602 aa  207  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.88 
 
 		 802 aa  207  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 870 aa  201  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.08 
 
 		 938 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.12 
 
 		 2552 aa  197  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  32.85 
 
 		 1531 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.76 
 
 		 845 aa  197  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.36 
 
 		 929 aa  195  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.44 
 
 		 786 aa  192  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 963 aa  191  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  34.72 
 
 		 415 aa  189  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  37.78 
 
 		 463 aa  188  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  34.17 
 
 		 1987 aa  186  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 		 819 aa  185  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.21 
 
 		 777 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  37.71 
 
 		 1095 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 		 687 aa  181  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  32.52 
 
 		 546 aa  179  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 		 652 aa  178  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.93 
 
 		 439 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.44 
 
 		 734 aa  177  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>