171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0391 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 486 aa  962    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  49.07 
 
 		 1682 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  51.52 
 
 		 2122 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  48.79 
 
 		 322 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  48.79 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  48.18 
 
 		 322 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  44.82 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  38.42 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.48 
 
 		 1383 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  37.41 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  34.86 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  33.62 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  36.13 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  32.22 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 		 963 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  34.56 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  35.49 
 
 		 687 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  34.75 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  29.88 
 
 		 653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  35.79 
 
 		 352 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 652 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  28.44 
 
 		 1454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 795 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.08 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 774 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  34.05 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  32.13 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  31.73 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.15 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 		 603 aa  87  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  30.49 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  26.83 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  29.01 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  28.02 
 
 		 603 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 861 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 		 848 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  28.27 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  29.39 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  39.81 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  23.85 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.25 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  22.65 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.77 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  27.92 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  27.35 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.86 
 
 		 1812 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  24.44 
 
 		 1735 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  28.32 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  23.67 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.47 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  23.15 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.57 
 
 		 616 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.85 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  36.79 
 
 		 1131 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  27.15 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.04 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  26.57 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  29.82 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.7 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  29.82 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.82 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4342  Pyrrolo-quinoline quinone  22.68 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  22.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.41 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  22.41 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.68 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.68 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.61 
 
 		 1293 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.32 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.32 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.32 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  26.62 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 534 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  29.08 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.78 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  24.75 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 630 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.02 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  23.1 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.13 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.02 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  34.31 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.02 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0806  Pyrrolo-quinoline quinone  30.23 
 
 		 577 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2689  Pyrrolo-quinoline quinone  21.86 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  23.28 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  23.14 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0591  hypothetical protein  35 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  22.42 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  22.42 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0883  Pyrrolo-quinoline quinone  22.53 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0722286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  22.63 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  26.26 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>