More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0401 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 469 aa  957    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  63.3 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  63.66 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  39.86 
 
 		 412 aa  273  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  40.78 
 
 		 445 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  30.63 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 687 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 963 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 		 484 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  28.67 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  30.7 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 		 795 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 		 774 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  27.33 
 
 		 445 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.42 
 
 		 352 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 652 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.32 
 
 		 653 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  43.65 
 
 		 1454 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  30.25 
 
 		 1241 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  30.25 
 
 		 1328 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4237  Pyrrolo-quinoline quinone  34.67 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000286239  hitchhiker  0.000138853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  27.42 
 
 		 2122 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 611 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1682 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.71 
 
 		 1812 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  30.55 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  28.97 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 		 1383 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 		 611 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.05 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  23.96 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.22 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  25.83 
 
 		 901 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.45 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.63 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.18 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  22.84 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  34.31 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  33.09 
 
 		 809 aa  63.9  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.03 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.86 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  24.17 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.79 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.79 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.79 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.62 
 
 		 697 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  31.03 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  24.75 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.66 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  26.33 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 		 705 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  21.54 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.48 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 861 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.2 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  31.25 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.52 
 
 		 1300 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  39.5 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25.14 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.67 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.11 
 
 		 834 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.62 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.4 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.66 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  28.47 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.62 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.93 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.09 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  28.3 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.52 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  33.65 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.74 
 
 		 2272 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  28.68 
 
 		 718 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 		 706 aa  56.6  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 		 577 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.71 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>