More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3660 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
555 aa  1140    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  53.36 
 
 
558 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  55.94 
 
 
561 aa  594  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  51.07 
 
 
562 aa  589  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.83 
 
 
576 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  35.62 
 
 
580 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.05 
 
 
597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  34.62 
 
 
591 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  34.1 
 
 
580 aa  282  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  34.93 
 
 
554 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.52 
 
 
582 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.2 
 
 
583 aa  280  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  34.62 
 
 
595 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  34.44 
 
 
595 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.44 
 
 
595 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.62 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  33.76 
 
 
602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.62 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.81 
 
 
587 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  34.07 
 
 
579 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  34.31 
 
 
587 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.84 
 
 
584 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.65 
 
 
584 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  34.83 
 
 
572 aa  269  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.6 
 
 
588 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  33.69 
 
 
727 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.03 
 
 
589 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.01 
 
 
588 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  31.49 
 
 
592 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.77 
 
 
707 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  34.11 
 
 
702 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.97 
 
 
579 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.27 
 
 
697 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
587 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
705 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.74 
 
 
678 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.94 
 
 
724 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
549 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  34.43 
 
 
720 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.15 
 
 
602 aa  256  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  32.7 
 
 
706 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
711 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  33.08 
 
 
698 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.99 
 
 
562 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  32.31 
 
 
730 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.43 
 
 
726 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  33.14 
 
 
570 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.4 
 
 
623 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  32.2 
 
 
601 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 
718 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.21 
 
 
623 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  32.1 
 
 
615 aa  250  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
541 aa  249  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.52 
 
 
631 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  33.52 
 
 
631 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  32.04 
 
 
601 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.39 
 
 
737 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  33.97 
 
 
593 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  31.32 
 
 
573 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  31.32 
 
 
573 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
712 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.13 
 
 
573 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.15 
 
 
631 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.78 
 
 
726 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
575 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.18 
 
 
580 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  32.23 
 
 
727 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 
600 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.33 
 
 
608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.98 
 
 
601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  33.14 
 
 
607 aa  241  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  31.77 
 
 
718 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  30.09 
 
 
623 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
577 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  32.53 
 
 
620 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.7 
 
 
606 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.13 
 
 
575 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.34 
 
 
575 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  31.57 
 
 
619 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  32.02 
 
 
738 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  32.02 
 
 
709 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  31.96 
 
 
575 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  30.67 
 
 
605 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.46 
 
 
575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.09 
 
 
601 aa  236  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 
618 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32 
 
 
599 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  30.34 
 
 
625 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000100555  unclonable  0.000000320672 
 
 
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  30.99 
 
 
600 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 
721 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32 
 
 
601 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  30.38 
 
 
576 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1809  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.43 
 
 
601 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2145  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.43 
 
 
601 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.885263  normal  0.307838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  33.27 
 
 
577 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  30.96 
 
 
606 aa  232  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.38 
 
 
601 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.41 
 
 
566 aa  231  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  31.24 
 
 
599 aa  230  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  29.84 
 
 
600 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>