More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2415 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  83.15 
 
 
576 aa  966    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  100 
 
 
577 aa  1191    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  70.43 
 
 
573 aa  851    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  47.57 
 
 
568 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  41.45 
 
 
614 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  38.57 
 
 
612 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  38.4 
 
 
612 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  38.32 
 
 
613 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  39.2 
 
 
585 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  37.83 
 
 
570 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.68 
 
 
576 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.8 
 
 
573 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  34.8 
 
 
573 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  37.62 
 
 
554 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  34.8 
 
 
573 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  37.04 
 
 
579 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.15 
 
 
566 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  36.23 
 
 
569 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.17 
 
 
595 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
575 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  36.99 
 
 
591 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.39 
 
 
575 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  36.13 
 
 
572 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  35.35 
 
 
575 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  36.17 
 
 
595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  35.99 
 
 
595 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.16 
 
 
575 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.78 
 
 
584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.41 
 
 
584 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.58 
 
 
597 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  35.81 
 
 
580 aa  302  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  35.06 
 
 
678 aa  297  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.91 
 
 
587 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.91 
 
 
587 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  35.26 
 
 
580 aa  296  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  34.43 
 
 
592 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  35.38 
 
 
620 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.56 
 
 
587 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  37.25 
 
 
580 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.27 
 
 
588 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.33 
 
 
583 aa  293  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  34.08 
 
 
587 aa  293  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.1 
 
 
575 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.68 
 
 
588 aa  291  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  34.3 
 
 
631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  34.3 
 
 
631 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.55 
 
 
579 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.12 
 
 
631 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.68 
 
 
602 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  34.41 
 
 
718 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.39 
 
 
589 aa  286  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  33.71 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  35.39 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  35.37 
 
 
525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
623 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.6 
 
 
582 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  34.16 
 
 
721 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
623 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
587 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  34.07 
 
 
705 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.69 
 
 
707 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  34.36 
 
 
738 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 
709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  34.65 
 
 
730 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
712 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  34.15 
 
 
726 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  33.21 
 
 
563 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  32.96 
 
 
706 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  34.39 
 
 
577 aa  267  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.77 
 
 
724 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  35.35 
 
 
720 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.84 
 
 
697 aa  266  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  34 
 
 
541 aa  266  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  32.73 
 
 
718 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  35.43 
 
 
549 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  33.69 
 
 
702 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.49 
 
 
737 aa  263  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  32.57 
 
 
545 aa  263  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  33.52 
 
 
604 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  33.27 
 
 
602 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  34.65 
 
 
601 aa  261  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  34.31 
 
 
727 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.89 
 
 
606 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  33.7 
 
 
601 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  31.93 
 
 
615 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  31.89 
 
 
619 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.09 
 
 
562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  32.6 
 
 
605 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  33.89 
 
 
562 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  32.1 
 
 
600 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.6 
 
 
606 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  33.72 
 
 
528 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
698 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  32.77 
 
 
616 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.21 
 
 
726 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  31.5 
 
 
600 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.95 
 
 
613 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
561 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.33 
 
 
608 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>