More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3898 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 423 aa  859    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  48.43 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  38.9 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  36.07 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  35.1 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  36.54 
 
 		 484 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  38.22 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 963 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  37.89 
 
 		 475 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  36.13 
 
 		 653 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 687 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 		 652 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 774 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 795 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  35.33 
 
 		 352 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 		 1454 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1682 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  34.65 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  28.15 
 
 		 611 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  33.78 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.14 
 
 		 2122 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  29.7 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  29.19 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  29.19 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  29.4 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.63 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.04 
 
 		 457 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  34.04 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  28.03 
 
 		 901 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  28.85 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  29.39 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 		 1383 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.65 
 
 		 616 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.71 
 
 		 1812 aa  103  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  29.01 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  27.12 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.51 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 		 611 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  26.71 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  29.15 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  29.89 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.96 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.14 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.58 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  28.66 
 
 		 546 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  29.9 
 
 		 705 aa  87  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 809 aa  87  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.07 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.53 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.53 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 861 aa  83.2  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.83 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.14 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.84 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.38 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.14 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.12 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.14 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.21 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  30.36 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.14 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.34 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.68 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1067 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 		 797 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.24 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  33.01 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.15 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.94 
 
 		 2272 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  28.87 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.42 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  28.87 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  35.59 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25.19 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  23.14 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.14 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  26.48 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.14 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.14 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  23.14 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.14 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.8 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.01 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>