More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6658 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  100 
 
 
616 aa  1282    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  40.55 
 
 
611 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.88 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
687 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 
431 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  33.67 
 
 
475 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
774 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.38 
 
 
484 aa  103  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 
423 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 
652 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
963 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 
415 aa  100  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  27.27 
 
 
1812 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.13 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.57 
 
 
402 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  21.93 
 
 
606 aa  92.8  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 
450 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  30.67 
 
 
371 aa  88.2  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  30.73 
 
 
371 aa  88.2  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  31.61 
 
 
395 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.67 
 
 
371 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  31.61 
 
 
395 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  27.35 
 
 
901 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  21.47 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  23.03 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 
1454 aa  84.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  21.77 
 
 
463 aa  84  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
611 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.77 
 
 
385 aa  83.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.07 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.66 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.81 
 
 
392 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  26.39 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.43 
 
 
514 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 
797 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  22.94 
 
 
392 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.94 
 
 
392 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.39 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.94 
 
 
392 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  22.94 
 
 
392 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.94 
 
 
392 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.22 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.06 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  23.22 
 
 
795 aa  77.4  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.94 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.94 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.51 
 
 
392 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 
392 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 
392 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.51 
 
 
392 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  24.54 
 
 
422 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 
392 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 
392 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.72 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.17 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  27.83 
 
 
834 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.86 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 
619 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.68 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  29.21 
 
 
259 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.29 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  22.19 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.74 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  20.73 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 
365 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  21.6 
 
 
379 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.94 
 
 
1311 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  23.51 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  21.57 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.19 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  23.98 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  21.99 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.96 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  28.35 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  24.14 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.13 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.89 
 
 
386 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  28.02 
 
 
313 aa  67  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2363  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
274 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  25.55 
 
 
374 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  26.94 
 
 
497 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  28.35 
 
 
363 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  23.02 
 
 
450 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 
447 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
390 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  20.72 
 
 
392 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.46 
 
 
415 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>