275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2941 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 396 aa  812    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 652 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 		 475 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  31.56 
 
 		 653 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 687 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 774 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  24.61 
 
 		 795 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 963 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.42 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  24.37 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  24.49 
 
 		 861 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.9 
 
 		 1454 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  22.46 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1682 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.13 
 
 		 611 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 		 797 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.8 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.41 
 
 		 901 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  21.8 
 
 		 371 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.91 
 
 		 2122 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.62 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.07 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.42 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.6 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  24.54 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  26.76 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.92 
 
 		 1812 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  23.42 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.11 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.11 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  24.35 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  22.39 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.42 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.42 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.55 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  20.64 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.42 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.64 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  23.65 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  26.83 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.17 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  24.91 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24.91 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.65 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  19.45 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.14 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  22.93 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.12 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  21.41 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.36 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.49 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  21.18 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  21.81 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.81 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.81 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  21.81 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.81 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.81 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.26 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  22.44 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.62 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.81 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.81 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  21 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.38 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  22.01 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  24.15 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  22.01 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.49 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 611 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.97 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.02 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  21 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.85 
 
 		 1383 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  19.84 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.39 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.24 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  22.26 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.24 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>