162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1379 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 322 aa  641    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  94.72 
 
 		 322 aa  617  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  95.65 
 
 		 322 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  75.16 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  46.18 
 
 		 1682 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.1 
 
 		 2122 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  48.18 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  37.05 
 
 		 440 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  36.12 
 
 		 431 aa  182  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.4 
 
 		 1383 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  34.77 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  36.23 
 
 		 463 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  35.31 
 
 		 963 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  36.25 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 546 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 687 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 652 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  29.5 
 
 		 653 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.7 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30.74 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 774 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  31.97 
 
 		 457 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 		 1454 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.31 
 
 		 484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 795 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32.17 
 
 		 371 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.17 
 
 		 450 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.66 
 
 		 901 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  29.75 
 
 		 371 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 861 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 		 603 aa  89.4  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  23.46 
 
 		 487 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.62 
 
 		 611 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.74 
 
 		 1812 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 		 365 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 		 412 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 603 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  30.87 
 
 		 371 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  23.2 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.15 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25.15 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  26.7 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  23.78 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  23.13 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  24.03 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  20.82 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  29.22 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7435  hypothetical protein  25.94 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4046  hypothetical protein  25.94 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00161846  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  26.78 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  25.96 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  27.84 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 834 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  24.64 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 848 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.66 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  19.94 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  22.96 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  24.3 
 
 		 630 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  24.87 
 
 		 466 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  24.2 
 
 		 645 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  22.87 
 
 		 616 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 		 389 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.1 
 
 		 2036 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.75 
 
 		 557 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0883  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0722286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.53 
 
 		 2272 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.15 
 
 		 1969 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.74 
 
 		 809 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.99 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  24.38 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.15 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 797 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  20.44 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  30.08 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  30.08 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.08 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.08 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.08 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.08 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>