250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0513 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 422 aa  845    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  82.23 
 
 		 422 aa  673    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  44.41 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  33.44 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.49 
 
 		 1454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 774 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 687 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  36.71 
 
 		 901 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 963 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.37 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.88 
 
 		 653 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.15 
 
 		 352 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 652 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 611 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 795 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  28.62 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.96 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.61 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  30.13 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  32.86 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.21 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.3 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  26.67 
 
 		 1241 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.36 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  25.33 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  26.67 
 
 		 1328 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  28.77 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  26.78 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.97 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.33 
 
 		 797 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 		 643 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1067 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.8 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.2 
 
 		 2272 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.1 
 
 		 1812 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.56 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.06 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 616 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  30.05 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.68 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  31.68 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.27 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.09 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  26.06 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  27.71 
 
 		 556 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.23 
 
 		 716 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  22.67 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.4 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  29.56 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  31.79 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  24.84 
 
 		 1300 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.76 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.64 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  26.74 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.74 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0522  quino protein  25.94 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  22.1 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.85 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  22.1 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 		 581 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.69 
 
 		 2036 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.69 
 
 		 1969 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  22.92 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.44 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.24 
 
 		 1383 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 861 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 820 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  29.31 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  26.72 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.5 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.85 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0582  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.812129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  22.87 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.21 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  22.87 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 531 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  27.12 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  31.21 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  29.15 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.51 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  21.41 
 
 		 631 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.77 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>